More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09910 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09910  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  100 
 
 		 531 aa  1079    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000618646 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1711  NusB/RsmB/TIM44  44.81 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07960  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  41.29 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  32.65 
 
 		 449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0866  NusB/RsmB/TIM44  30.83 
 
 		 463 aa  176  8e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000084773  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  31.05 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  31.45 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  35.68 
 
 		 452 aa  172  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  32.25 
 
 		 444 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  32.84 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  31.12 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  32.76 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  29.51 
 
 		 451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  29.73 
 
 		 447 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  29.95 
 
 		 438 aa  162  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  29.76 
 
 		 442 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  33.17 
 
 		 451 aa  160  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  29.6 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  31.73 
 
 		 440 aa  159  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  28.13 
 
 		 452 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  31.79 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  29.76 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  28.88 
 
 		 453 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  32.53 
 
 		 444 aa  154  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  30.18 
 
 		 452 aa  153  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  28.61 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  28.61 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  28.61 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  28.61 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  28.61 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  30.46 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  28.61 
 
 		 429 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  28.61 
 
 		 429 aa  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  26.91 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  31.73 
 
 		 439 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  28.1 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  31.2 
 
 		 444 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  30.65 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  27.16 
 
 		 433 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  31 
 
 		 444 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  27.99 
 
 		 429 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  30.73 
 
 		 444 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  28.71 
 
 		 446 aa  148  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  30.46 
 
 		 444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  30.73 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  30.73 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  30.73 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  30.73 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  31 
 
 		 444 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  28.2 
 
 		 448 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  28.31 
 
 		 444 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  29.65 
 
 		 451 aa  146  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  27.76 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  28.61 
 
 		 468 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.95 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  29.43 
 
 		 448 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  30.99 
 
 		 527 aa  143  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  29.17 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  27.32 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  30.66 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  28.22 
 
 		 449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  29.13 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  27.15 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  29.49 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  27.2 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  27.85 
 
 		 429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  34.87 
 
 		 420 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  28.12 
 
 		 452 aa  140  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  33.22 
 
 		 416 aa  140  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  26.39 
 
 		 448 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  26.54 
 
 		 448 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  27.59 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  27.59 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  27.59 
 
 		 429 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  31.69 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  29.18 
 
 		 443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  27.23 
 
 		 435 aa  137  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  27.23 
 
 		 435 aa  137  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  27.34 
 
 		 429 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  27.21 
 
 		 456 aa  137  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  31.61 
 
 		 448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  30.73 
 
 		 451 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  30.73 
 
 		 451 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  34.1 
 
 		 420 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  34.1 
 
 		 420 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  34.1 
 
 		 420 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  33.41 
 
 		 452 aa  136  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  34.1 
 
 		 420 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  34.1 
 
 		 420 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  34.1 
 
 		 420 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  34.1 
 
 		 420 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  28.41 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  31.44 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  32.28 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.73 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  26.54 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  27.01 
 
 		 437 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.9 
 
 		 440 aa  133  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  26.21 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  32.18 
 
 		 455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>