More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09410 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  54.71 
 
 		 626 aa  676    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  100 
 
 		 618 aa  1268    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  49.84 
 
 		 642 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  39.82 
 
 		 655 aa  406  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  39.6 
 
 		 652 aa  306  8.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  38.32 
 
 		 584 aa  296  7e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  31.57 
 
 		 599 aa  296  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  34.54 
 
 		 629 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  43.52 
 
 		 599 aa  292  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.63 
 
 		 605 aa  290  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  41.86 
 
 		 652 aa  290  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  35.01 
 
 		 588 aa  289  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  41.82 
 
 		 651 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  35.61 
 
 		 656 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  34.51 
 
 		 601 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.05 
 
 		 600 aa  287  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.17 
 
 		 598 aa  287  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  36.69 
 
 		 623 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  39.09 
 
 		 667 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  33.26 
 
 		 601 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  29.54 
 
 		 571 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  38.01 
 
 		 587 aa  282  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.25 
 
 		 588 aa  282  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  35.76 
 
 		 651 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  41.78 
 
 		 664 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  29.36 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  29.36 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  29.36 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  41.58 
 
 		 655 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  29.36 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  29.36 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  41.6 
 
 		 660 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  40.97 
 
 		 663 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.39 
 
 		 613 aa  281  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  41.56 
 
 		 660 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  29.29 
 
 		 598 aa  280  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  41.42 
 
 		 638 aa  280  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  41.3 
 
 		 660 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  38.78 
 
 		 655 aa  279  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  35.24 
 
 		 629 aa  279  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  41.04 
 
 		 660 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  31.51 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  31.51 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  38.12 
 
 		 682 aa  277  3e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  34.61 
 
 		 632 aa  277  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  35.83 
 
 		 604 aa  277  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  36.04 
 
 		 616 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  42.45 
 
 		 663 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  34.77 
 
 		 699 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  35.26 
 
 		 616 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  33.41 
 
 		 604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.02 
 
 		 587 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  33.28 
 
 		 578 aa  274  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  31.38 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  31.04 
 
 		 600 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  33.14 
 
 		 582 aa  273  9e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  33.46 
 
 		 583 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  33.63 
 
 		 572 aa  272  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  33.63 
 
 		 553 aa  272  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  36.38 
 
 		 641 aa  271  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  38.56 
 
 		 583 aa  270  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  38.26 
 
 		 656 aa  270  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  36.94 
 
 		 686 aa  270  7e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  37.17 
 
 		 613 aa  270  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  37.05 
 
 		 595 aa  270  8e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  36.05 
 
 		 666 aa  269  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  34.86 
 
 		 634 aa  269  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  35.71 
 
 		 645 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  36.95 
 
 		 577 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  35.83 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  37 
 
 		 694 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  38.72 
 
 		 617 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  41.96 
 
 		 559 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  35.78 
 
 		 636 aa  267  4e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  36.82 
 
 		 595 aa  267  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  37.3 
 
 		 703 aa  267  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  34.96 
 
 		 628 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  35.99 
 
 		 645 aa  266  8e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.37 
 
 		 592 aa  266  8e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  34.98 
 
 		 660 aa  266  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  34.42 
 
 		 690 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  36.83 
 
 		 594 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  36.3 
 
 		 627 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  36.66 
 
 		 614 aa  265  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  35.71 
 
 		 604 aa  265  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  34.43 
 
 		 676 aa  265  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  37.21 
 
 		 583 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  38.89 
 
 		 657 aa  265  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  36.71 
 
 		 684 aa  264  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  32.55 
 
 		 656 aa  264  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  37.25 
 
 		 629 aa  264  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  37.02 
 
 		 700 aa  264  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  34.47 
 
 		 624 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  38.77 
 
 		 631 aa  263  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  37.5 
 
 		 565 aa  263  6.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  36.42 
 
 		 642 aa  263  6.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  36.46 
 
 		 648 aa  262  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  36.19 
 
 		 677 aa  263  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  34.39 
 
 		 574 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  34.48 
 
 		 641 aa  261  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>