More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_09270  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
388 aa  808    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1849  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.47 
 
 
382 aa  412  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08750  acyl-CoA dehydrogenase  47.52 
 
 
386 aa  361  1e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.456879  normal  0.674074 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1840  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.98 
 
 
384 aa  240  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0618853  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.07 
 
 
394 aa  239  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0310  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.82 
 
 
383 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4600  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.94 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09220  acyl-CoA dehydrogenase  36.15 
 
 
385 aa  212  7.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605884  normal  0.299074 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08800  acyl-CoA dehydrogenase  34.56 
 
 
384 aa  210  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.320154 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1947  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.39 
 
 
383 aa  208  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0267578  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1468  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.66 
 
 
383 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.283366  normal  0.0792636 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1911  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.39 
 
 
383 aa  208  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1816  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.66 
 
 
383 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.297013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1936  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.39 
 
 
383 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0137614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1987  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.66 
 
 
383 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143395  hitchhiker  0.00158428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1898  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.39 
 
 
383 aa  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1487  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.66 
 
 
383 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971669 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.39 
 
 
383 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1501  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.39 
 
 
384 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2411  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.39 
 
 
383 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1452  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.66 
 
 
383 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.215854  normal  0.288661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01664  predicted acyl-CoA dehydrogenase  34.39 
 
 
383 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01653  hypothetical protein  34.39 
 
 
383 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1403  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.98 
 
 
381 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1388  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.13 
 
 
383 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.977333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1021  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.45 
 
 
383 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2878  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.23 
 
 
391 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.09 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.509328  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0570  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  31.78 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.741044  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  32.28 
 
 
380 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.82 
 
 
380 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.95 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00043  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  29.27 
 
 
380 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3560  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.27 
 
 
380 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3616  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  29.27 
 
 
380 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0669979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  29.27 
 
 
380 aa  167  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  29.27 
 
 
380 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00042  hypothetical protein  29.27 
 
 
380 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0041  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  29.27 
 
 
380 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0040  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  29.27 
 
 
380 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.95 
 
 
375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0080  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  29.02 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  29.02 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0079  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  29.02 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0999313  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1375  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.82 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178062  normal  0.0980928 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0949  acyl-CoA dehydrogenase-like  30.08 
 
 
385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0416018  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  29.02 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0081  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  29.02 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124381  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.15 
 
 
374 aa  163  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  32.16 
 
 
389 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01704  acyl-CoA dehydrogenase family member 8  30.14 
 
 
393 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791292  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3838  acyl-CoA dehydrogenase-like  29.84 
 
 
376 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0108  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.48 
 
 
376 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.55 
 
 
389 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1871  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.77 
 
 
385 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.95 
 
 
381 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4185  acyl-CoA dehydrogenase-like  29.57 
 
 
376 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.35 
 
 
389 aa  159  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.87 
 
 
382 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.88 
 
 
375 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.34 
 
 
382 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2973  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.35 
 
 
389 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.698816  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2828  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.35 
 
 
389 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.35 
 
 
389 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.61 
 
 
375 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.62 
 
 
389 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.08 
 
 
389 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.295941  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  28.42 
 
 
381 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  28.42 
 
 
381 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.08 
 
 
389 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.37 
 
 
380 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1150  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.35 
 
 
380 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  31.35 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0714  Acyl-CoA dehydrogenase  31.56 
 
 
377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.14 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.672922 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2082  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.37 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.49 
 
 
377 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1275  acyl-CoA dehydrogenase  30.77 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3093  acyl-CoA dehydrogenase-like  27.75 
 
 
382 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  28.42 
 
 
381 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  28.42 
 
 
381 aa  156  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  28.42 
 
 
381 aa  156  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  28.42 
 
 
381 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  28.42 
 
 
381 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  29.46 
 
 
375 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4774  acyl-CoA dehydrogenase  30.34 
 
 
387 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.42 
 
 
381 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  28.42 
 
 
381 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01905  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  28.76 
 
 
397 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0274  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.62 
 
 
382 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.630772  normal  0.481537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2684  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.11 
 
 
375 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3527  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.03 
 
 
386 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496474  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.18 
 
 
383 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4257  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.14 
 
 
376 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3937  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.13 
 
 
385 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.818683  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3301  acyl-CoA dehydrogenase-like  28.61 
 
 
381 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.06 
 
 
378 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.22 
 
 
396 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  28.15 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.48 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>