More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08320 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  100 
 
 		 460 aa  963    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  39.36 
 
 		 451 aa  308  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  34.27 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.47 
 
 		 370 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  29.38 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 383 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.23 
 
 		 390 aa  113  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.09 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  24.93 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  26.02 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  26.02 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  25.25 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  26.24 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  23.78 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  26.83 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  22.31 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.36 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.25 
 
 		 370 aa  99.8  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  27.08 
 
 		 398 aa  99  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.46 
 
 		 378 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.81 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.79 
 
 		 391 aa  97.1  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  33.5 
 
 		 305 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.61 
 
 		 391 aa  96.3  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  32.75 
 
 		 363 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  28.33 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  31.16 
 
 		 325 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  26.36 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.49 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  28.65 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  24.01 
 
 		 477 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  23.17 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.39 
 
 		 374 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.39 
 
 		 374 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  33.16 
 
 		 383 aa  94.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.84 
 
 		 386 aa  93.6  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  32.28 
 
 		 387 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  34.25 
 
 		 385 aa  90.9  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  31.25 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  33.99 
 
 		 403 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  31.09 
 
 		 386 aa  86.7  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  23.95 
 
 		 443 aa  86.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  33.5 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.44 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.53 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.8 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  23.69 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  32.82 
 
 		 201 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  22.57 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  30.39 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  22.74 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  22.99 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3350  integrase  24.09 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  21.94 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  28.49 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  24.51 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  29.13 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  24.44 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  26.75 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  25.73 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  25.31 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 368 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  27.93 
 
 		 209 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  27.93 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  24.64 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  30.14 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.75 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  24.71 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  24.92 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.89 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  31.15 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  24.83 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  23.92 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  25.47 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  28.04 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  29.44 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  31.21 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  31.21 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  25.47 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  23.23 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  26.24 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  22.17 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  29.14 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  24.11 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  30.29 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  34.86 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  24.62 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  22.54 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  20.99 
 
 		 463 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25.4 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  28.57 
 
 		 380 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  25.63 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  24.65 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.62 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  21.71 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.98 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  22.14 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.98 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  28.57 
 
 		 407 aa  67  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>