38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08230 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  100 
 
 		 403 aa  823    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  26.23 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  26.23 
 
 		 396 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  25.75 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  26.07 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  25.6 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  25.9 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  26.04 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  26.52 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  28.86 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  23.01 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  25.17 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  27.91 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  21.81 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  24.84 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  28.19 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0840  major capsid protein HK97  23.9 
 
 		 313 aa  53.5  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  27.78 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  23.53 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  28.26 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  26.48 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  25.94 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  26.09 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  24.6 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  25.33 
 
 		 421 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  23.13 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  25.09 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  26.63 
 
 		 379 aa  46.6  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  25.32 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  26.63 
 
 		 379 aa  46.6  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  25.54 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  24.44 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  27.96 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  22.57 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  22.57 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  22.57 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  27.08 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  22.89 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>