More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07030 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_07030  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 
165 aa  343  9e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000194314  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  67.74 
 
 
192 aa  218  2e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12860  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.15 
 
 
174 aa  194  6e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  56.38 
 
 
167 aa  166  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.22 
 
 
164 aa  144  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  45.1 
 
 
159 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.83978e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 
166 aa  141  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.95843e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.97 
 
 
163 aa  141  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  47.65 
 
 
165 aa  140  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  38.93 
 
 
162 aa  140  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.08 
 
 
179 aa  140  1e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  41.56 
 
 
164 aa  139  2e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.87 
 
 
160 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.41 
 
 
178 aa  134  6e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  45.75 
 
 
181 aa  132  2e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 
156 aa  132  2e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  40.27 
 
 
161 aa  131  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  45.1 
 
 
181 aa  131  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 
164 aa  131  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.33 
 
 
165 aa  130  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 
182 aa  129  1e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.61 
 
 
167 aa  128  4e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 
181 aa  127  5e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  46.15 
 
 
181 aa  127  7e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  45.81 
 
 
183 aa  126  1e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 
173 aa  125  2e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.86785e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 
181 aa  125  2e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  41.33 
 
 
172 aa  125  2e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  8.64662e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  46.2 
 
 
180 aa  124  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.62 
 
 
173 aa  124  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  42.11 
 
 
180 aa  124  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42 
 
 
164 aa  124  8e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  43.51 
 
 
165 aa  123  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 
164 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.74044e-15 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 
173 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 
164 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 
173 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.76 
 
 
184 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  44.37 
 
 
184 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 
171 aa  120  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.23238e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 
176 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.68 
 
 
183 aa  120  1e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  48.03 
 
 
182 aa  120  1e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  41.94 
 
 
156 aa  119  1e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 
164 aa  119  2e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.11 
 
 
162 aa  119  2e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  45.75 
 
 
168 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.84 
 
 
165 aa  118  4e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  45.75 
 
 
168 aa  117  5e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.28 
 
 
173 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 
180 aa  117  8e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  45.16 
 
 
183 aa  117  8e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 
174 aa  116  1e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 
174 aa  116  1e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.86306e-05 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 
174 aa  116  1e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 
180 aa  116  1e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  37.09 
 
 
158 aa  116  1e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 
164 aa  116  1e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 
180 aa  115  2e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 
180 aa  115  2e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  44.08 
 
 
174 aa  115  2e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  41.48 
 
 
173 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 
168 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  44.03 
 
 
186 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 
175 aa  114  4e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.96 
 
 
175 aa  114  4e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  43.4 
 
 
186 aa  114  4e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  44.52 
 
 
182 aa  115  4e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  45.03 
 
 
182 aa  114  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 
173 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  41.89 
 
 
157 aa  114  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 
173 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  44.87 
 
 
180 aa  114  7e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  44.87 
 
 
180 aa  114  7e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  44.87 
 
 
180 aa  114  7e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  44.87 
 
 
180 aa  114  7e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  41.48 
 
 
173 aa  113  9e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  41.4 
 
 
168 aa  113  9e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  42.22 
 
 
189 aa  113  1e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  41.48 
 
 
173 aa  113  1e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.67 
 
 
176 aa  113  1e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  42.96 
 
 
173 aa  112  2e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 
180 aa  112  2e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  42.96 
 
 
173 aa  112  2e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  42.96 
 
 
173 aa  112  2e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 
167 aa  112  2e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  44.87 
 
 
284 aa  112  2e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  42.96 
 
 
173 aa  112  2e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  44.87 
 
 
275 aa  112  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.96 
 
 
173 aa  112  2e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  43.87 
 
 
182 aa  112  2e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  42.96 
 
 
173 aa  112  2e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  42.96 
 
 
173 aa  112  2e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.26 
 
 
189 aa  112  2e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  43.87 
 
 
182 aa  112  2e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  42.96 
 
 
173 aa  112  2e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.48 
 
 
164 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.38 
 
 
175 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  42.22 
 
 
173 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.19 
 
 
166 aa  112  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>