141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05980 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05980  carbamate kinase  100 
 
 		 320 aa  658    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12560  carbamate kinase  83.54 
 
 		 321 aa  556  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3444  carbamate kinase  54.02 
 
 		 312 aa  332  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02546  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0673  carbamate kinase  52.73 
 
 		 317 aa  314  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000329636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06680  carbamate kinase  53.53 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06560  carbamate kinase  51.94 
 
 		 319 aa  308  8e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.298804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0679  carbamate kinase  52.41 
 
 		 317 aa  306  3e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.378738 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0651  carbamate kinase  48.87 
 
 		 310 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0787  carbamate kinase  51.61 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02380  carbamate kinase  50.48 
 
 		 317 aa  302  4.0000000000000003e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.720538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0242  carbamate kinase  51.92 
 
 		 313 aa  301  1e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000109106  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1429  carbamate kinase  52.56 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0183  carbamate kinase  51.94 
 
 		 310 aa  298  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1947  carbamate kinase  50.48 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0184546  normal  0.423275 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0426  carbamate kinase  51.77 
 
 		 310 aa  295  8e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0485  carbamate kinase  51.27 
 
 		 313 aa  288  7e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000618454  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00850  carbamate kinase  50.65 
 
 		 319 aa  288  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1228  carbamate kinase  47.74 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1253  carbamate kinase  47.74 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.661641  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2125  carbamate kinase  49.68 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2352  carbamate kinase  47.1 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2650  carbamate kinase  50.46 
 
 		 313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1665  carbamate kinase  49.68 
 
 		 313 aa  281  9e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0164  carbamate kinase  48.57 
 
 		 314 aa  271  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0160  carbamate kinase  47.94 
 
 		 314 aa  271  9e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0029  carbamate kinase  47.9 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0269  carbamate kinase  49.69 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000010285  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3199  carbamate kinase  48.39 
 
 		 310 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0818  carbamate kinase  48.06 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3034  carbamate kinase  48.06 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0834  carbamate kinase  48.06 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3007  carbamate kinase  48.06 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2476  carbamate kinase  48.87 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02707  predicted amino acid kinase  47.74 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02669  hypothetical protein  47.74 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4164  carbamate kinase  47.42 
 
 		 310 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2656  carbamate kinase  45.25 
 
 		 322 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.168651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2712  carbamate kinase  45.25 
 
 		 322 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2167  carbamate kinase  44.44 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2117  carbamate kinase  43.85 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.43365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0351  carbamate kinase  46.33 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0475  carbamate kinase  45.57 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4895  carbamate kinase  45.57 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.428226  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0344  carbamate kinase  44.94 
 
 		 320 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0410  carbamate kinase  44.94 
 
 		 320 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00340879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0423  carbamate kinase  45.25 
 
 		 320 aa  238  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1948  carbamate kinase  44.3 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.572312  hitchhiker  0.000272947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0247  carbamate kinase  44.34 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf130  carbamate kinase  45.05 
 
 		 312 aa  235  7e-61  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0069  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  43.22 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2318  carbamate kinase  44.76 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1788  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  44.41 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1927  carbamate kinase-like carbamoyl phosphate synthetase  42.81 
 
 		 312 aa  230  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0219816  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0039  carbamate kinase  45.89 
 
 		 309 aa  226  6e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2319  carbamate kinase  42.72 
 
 		 314 aa  225  7e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0388  putative carbamate kinase  44.9 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.662634 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3300  putative carbamate kinase  44.9 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3141  putative carbamate kinase  44.27 
 
 		 316 aa  223  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.463314  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0353  putative carbamate kinase  44.59 
 
 		 316 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3283  Carbamate kinase  44.9 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00278  predicted carbamate kinase-like protein  44.59 
 
 		 316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00282  hypothetical protein  44.59 
 
 		 316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0383  putative carbamate kinase  43.95 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0341  putative carbamate kinase  44.27 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2848  carbamate kinase  46.01 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1878  carbamate kinase  41.01 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03661  hypothetical protein  41.56 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03712  Carbamate kinase-like protein yahI  41.56 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4199  carbamate kinase  41.32 
 
 		 318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169191 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1838  carbamate kinase  41.14 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.955077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1620  carbamate kinase  39.37 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0172  carbamate kinase  41.32 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2426  carbamate kinase  40.95 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1036  carbamate kinase  43.04 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873124  normal  0.536796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4225  carbamate kinase  43.4 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.375863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1820  carbamate kinase  38.73 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0998  carbamate kinase  43.08 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3101  carbamate kinase  40.06 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000494592  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0999  carbamate kinase  42.77 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.782851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0529  carbamate kinase  40.51 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2798  Carbamate kinase  42.36 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2409  carbamate kinase  40.38 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4648  carbamate kinase  40.82 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2359  carbamate kinase  40.38 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5913  carbamate kinase  42.09 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2239  carbamate kinase  42.81 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126564  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1145  carbamate kinase  41.32 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.986133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68350  carbamate kinase  41.14 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.221419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4388  carbamate kinase  40.82 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692138  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1389  carbamate kinase  40.19 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373109  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2686  carbamate kinase  40.19 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1504  carbamate kinase  40.06 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521984  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1106  carbamate kinase  41.46 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0757388  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1784  Carbamate kinase  42.09 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00351606  normal  0.0183756 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0451  carbamate kinase  41.4 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0361431 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6441  carbamate kinase  39.17 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.841619  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1875  carbamate kinase  40.32 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6542  Carbamate kinase  40.38 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4868  carbamate kinase  41.56 
 
 		 310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4750  carbamate kinase  41.07 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>