More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05860 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05860  transposase  100 
 
 		 283 aa  600  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14520  transposase  91.87 
 
 		 283 aa  559  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04830  transposase  91.17 
 
 		 283 aa  548  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0367242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1125  Integrase catalytic region  75 
 
 		 284 aa  460  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0947963  hitchhiker  0.00000135034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2913  Integrase catalytic region  75 
 
 		 284 aa  460  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15050  transposase  73.24 
 
 		 285 aa  445  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.316809  normal  0.91579 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03250  transposase  72.28 
 
 		 286 aa  443  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01660  transposase  72.54 
 
 		 285 aa  439  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0405  Integrase catalytic region  73.23 
 
 		 272 aa  424  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0876667  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  41.2 
 
 		 279 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  41.2 
 
 		 279 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  41.2 
 
 		 279 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  41.2 
 
 		 279 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  40.64 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  40.64 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  40.28 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  39.93 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  39.93 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  39.93 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  39.93 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  39.93 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  39.93 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  39.93 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  39.93 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  39.93 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  39.93 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  39.93 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  40.28 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  40.51 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  40.07 
 
 		 278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  40.07 
 
 		 278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  38.6 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  38.6 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  39.85 
 
 		 268 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  39.85 
 
 		 268 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  39.48 
 
 		 268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  39.48 
 
 		 268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  37.01 
 
 		 277 aa  185  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  37.01 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  39.84 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  37.1 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  39.84 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  38.57 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  37.99 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  35.34 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  35.34 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  37.13 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  37.13 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  37.13 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  35.34 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  35.34 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  38.49 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  38.49 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  38.49 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  38.49 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  38.49 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2991  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 512 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2672  integrase catalytic region  39.08 
 
 		 512 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  36.19 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  36.13 
 
 		 270 aa  176  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  36.13 
 
 		 270 aa  176  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  37.19 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  37.19 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  37.19 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  37.19 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  37.19 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  36.84 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  35.06 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  34.55 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0196  integrase core subunit  36.26 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0908  integrase core subunit  36.26 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3759  integrase core subunit  36.26 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4172  integrase core subunit  36.26 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3998  integrase core subunit  36.26 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3122  integrase core subunit  36.26 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00391606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3804  integrase core subunit  36.26 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3902  integrase core subunit  36.26 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  35.06 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  38.37 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  38.37 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  35.71 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  38.37 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  38.37 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  35.71 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  35.71 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  35.83 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1529  integrase catalytic subunit  35.69 
 
 		 505 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.544255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1532  integrase catalytic subunit  35.69 
 
 		 505 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  34.98 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1303  integrase catalytic subunit  35.31 
 
 		 510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  38.5 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  33.96 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4798  integrase catalytic region  35.09 
 
 		 512 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285753  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  34.52 
 
 		 512 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  35.38 
 
 		 512 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0181  Integrase catalytic region  35.23 
 
 		 385 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3050  integrase catalytic subunit  33.8 
 
 		 512 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.985644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>