14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05630 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05630  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  458  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.502408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1591  hypothetical protein  57.66 
 
 		 227 aa  241  6e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174735 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17890  predicted membrane protein  52.47 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0780297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3048  membrane protein-like protein  49.06 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1004  hypothetical protein  44 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.222675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20890  predicted membrane protein  45.16 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04300  Ferric reductase like transmembrane component  39.41 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  normal  0.0690521 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1102  hypothetical protein  32.61 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000717083  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18520  hypothetical protein  38.57 
 
 		 229 aa  105  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1182  hypothetical protein  35.68 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000961119  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1013  hypothetical protein  35.38 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000440663  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00240  hypothetical protein  32.82 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336169 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03400  hypothetical protein  31.91 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08919  cytochrome P450, putative (Eurofung)  24.88 
 
 		 549 aa  41.6  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.781166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>