54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05010 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  57.69 
 
 		 2495 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  57.14 
 
 		 651 aa  97.8  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  56.25 
 
 		 478 aa  94  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  56.96 
 
 		 331 aa  93.6  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  58.75 
 
 		 502 aa  92.4  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  43.68 
 
 		 430 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  46.88 
 
 		 440 aa  88.2  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  53.85 
 
 		 811 aa  87.8  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  41.18 
 
 		 302 aa  86.3  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  50 
 
 		 750 aa  85.1  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  45.57 
 
 		 807 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  53.16 
 
 		 613 aa  82.8  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  55.26 
 
 		 377 aa  82  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  43.62 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  55.7 
 
 		 1732 aa  79  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  51.95 
 
 		 602 aa  78.2  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  47.73 
 
 		 817 aa  77.8  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  46.84 
 
 		 592 aa  76.6  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  48.75 
 
 		 532 aa  76.3  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  53.25 
 
 		 512 aa  76.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  44.87 
 
 		 454 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 753 aa  75.1  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  54.93 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  41.44 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  37.76 
 
 		 550 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  44.87 
 
 		 1131 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  44.87 
 
 		 1131 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  50 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  39.81 
 
 		 578 aa  70.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.56 
 
 		 762 aa  65.5  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  40.24 
 
 		 316 aa  65.1  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  41.03 
 
 		 697 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  32.17 
 
 		 552 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  42.11 
 
 		 891 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  34.58 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  33.04 
 
 		 1557 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  39.29 
 
 		 737 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  40.91 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  40 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1009 aa  55.1  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1002 aa  55.1  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  42.37 
 
 		 350 aa  49.3  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  38.36 
 
 		 2821 aa  48.5  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.97 
 
 		 268 aa  48.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  32.86 
 
 		 1025 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  24.39 
 
 		 293 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0535  YG repeat-containing cell wall-associated hydrolase  43.1 
 
 		 292 aa  46.2  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  39.08 
 
 		 271 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  34.38 
 
 		 1514 aa  45.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.42 
 
 		 339 aa  45.1  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  30 
 
 		 1527 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0109  fibronectin type III domain-containing protein  36.45 
 
 		 1225 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1413  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  25 
 
 		 437 aa  42.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00657496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>