261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04760 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1233  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  50.34 
 
 
704 aa  775    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02440  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  80.68 
 
 
740 aa  1276    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.187193  normal  0.336585 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1124  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  80.68 
 
 
740 aa  1291    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3050  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  54.55 
 
 
708 aa  823    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04760  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  100 
 
 
737 aa  1545    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.496041  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1001  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  49.19 
 
 
706 aa  721    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0791  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.93 
 
 
706 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1468  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.13 
 
 
708 aa  434  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.897136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0360  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  37.2 
 
 
712 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0277  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.14 
 
 
747 aa  432  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2086  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.96 
 
 
723 aa  429  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4718  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.17 
 
 
712 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1942  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.35 
 
 
734 aa  428  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0740  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.79 
 
 
704 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4846  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.17 
 
 
712 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04106  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.17 
 
 
712 aa  425  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3756  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  36.17 
 
 
712 aa  425  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4809  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.17 
 
 
712 aa  426  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5758  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.3 
 
 
712 aa  425  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3773  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.17 
 
 
712 aa  425  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4853  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.25 
 
 
712 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241457  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4798  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.25 
 
 
712 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4492  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.17 
 
 
712 aa  425  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04070  hypothetical protein  36.17 
 
 
712 aa  425  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0525  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.45 
 
 
712 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4734  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.25 
 
 
712 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.715295  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4703  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.25 
 
 
712 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4832  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.25 
 
 
712 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0437  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.67 
 
 
712 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4035  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.91 
 
 
712 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3580  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.05 
 
 
712 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0445  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.55 
 
 
706 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3691  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.91 
 
 
712 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3556  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.91 
 
 
712 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3748  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.99 
 
 
712 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0417  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.67 
 
 
712 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05713  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.17 
 
 
706 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000107  ribonucleotide reductase of class III (anaerobic) large subunit  36.57 
 
 
706 aa  419  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185061  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1125  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  35.01 
 
 
805 aa  414  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1275  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.18 
 
 
705 aa  415  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1540  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.4 
 
 
705 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.91 
 
 
705 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2834  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.53 
 
 
705 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1929  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.2 
 
 
802 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1600  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.35 
 
 
705 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2441  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.67 
 
 
705 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2511  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.53 
 
 
705 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2603  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.53 
 
 
705 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000597359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1650  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.73 
 
 
705 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.73 
 
 
705 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.837695  hitchhiker  0.000803625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1419  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.72 
 
 
704 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1687  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.73 
 
 
705 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.673685  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1665  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36 
 
 
705 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21480  ribonucleoside-triphosphate reductase class III catalytic subunit  34.72 
 
 
754 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3049  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.32 
 
 
705 aa  398  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0131887  normal  0.0662102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2619  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36 
 
 
705 aa  399  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2443  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.02 
 
 
705 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1539  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.38 
 
 
736 aa  392  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.854468  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2183  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.29 
 
 
616 aa  388  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2694  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.91 
 
 
616 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1317  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  34.14 
 
 
744 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2640  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.91 
 
 
616 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1116  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  36.32 
 
 
733 aa  385  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.287436  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0138  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  34.18 
 
 
738 aa  384  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.450422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2300  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  33.94 
 
 
765 aa  382  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2830  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.54 
 
 
705 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2516  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  30.09 
 
 
705 aa  273  6e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0127  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.98 
 
 
736 aa  259  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1548  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  28.23 
 
 
670 aa  250  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00598152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0693  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.7 
 
 
676 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0048  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.8 
 
 
759 aa  233  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1054  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.76 
 
 
746 aa  229  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3629  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.84 
 
 
618 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3398  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.84 
 
 
618 aa  228  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3360  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.84 
 
 
618 aa  228  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3663  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.84 
 
 
618 aa  228  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0424871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3614  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.84 
 
 
618 aa  228  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.58287e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3310  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.69 
 
 
618 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0351  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.65 
 
 
789 aa  227  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.478958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1604  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.53 
 
 
618 aa  225  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000379053  hitchhiker  0.000000212198 
 
 
-
 
NC_002950  PG1260  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  26.16 
 
 
798 aa  226  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.64 
 
 
619 aa  225  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00561072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2252  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.47 
 
 
618 aa  225  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00612019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0702  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.01 
 
 
769 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000299094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3711  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.49 
 
 
619 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0130664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.08 
 
 
618 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2571  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  27.51 
 
 
775 aa  202  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3590  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.46 
 
 
720 aa  188  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1071  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  27.79 
 
 
1197 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00208711  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2622  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  25.16 
 
 
719 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1057  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.29 
 
 
721 aa  138  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1449  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  24.08 
 
 
705 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.437594 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0535  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.84 
 
 
800 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000021031  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1227  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.66 
 
 
791 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.25361  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0728  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  24.5 
 
 
791 aa  127  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0906  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.08 
 
 
715 aa  122  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1601  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.35 
 
 
706 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18290  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  22.93 
 
 
816 aa  120  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1471  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  22.64 
 
 
791 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0823956  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1190  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  23.58 
 
 
690 aa  114  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.629609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>