More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04660 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_04660  ribosomal protein L31  100 
 
 
144 aa  264  3e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  hitchhiker  4.89926e-05 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0114  ribosomal protein L31  76.81 
 
 
139 aa  130  8e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.434874  normal  0.146385 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  77.14 
 
 
175 aa  127  4e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  72.86 
 
 
153 aa  127  8e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  3.20944e-09  hitchhiker  2.56974e-13 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  67.19 
 
 
74 aa  110  9e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  62.5 
 
 
66 aa  103  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  65.08 
 
 
66 aa  103  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  65.08 
 
 
66 aa  103  7e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  65.08 
 
 
65 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  67.19 
 
 
65 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  4.59753e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  60.32 
 
 
66 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
66 aa  101  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  63.64 
 
 
82 aa  101  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 
66 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  65.62 
 
 
65 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  60.32 
 
 
66 aa  100  7e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  64.06 
 
 
69 aa  100  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  64.06 
 
 
66 aa  100  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.89789e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  57.14 
 
 
66 aa  99.4  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  64.06 
 
 
66 aa  99.4  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.71245e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  58.57 
 
 
71 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  44.55 
 
 
94 aa  98.6  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 
81 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  56.94 
 
 
73 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.69936e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 
81 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 
81 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  57.14 
 
 
75 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  64.62 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 
69 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.41122e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 
71 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 
71 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 
72 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  56.25 
 
 
73 aa  97.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4636  ribosomal protein L31  67.8 
 
 
73 aa  97.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  58.82 
 
 
72 aa  97.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  60.61 
 
 
69 aa  97.1  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1068  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 
69 aa  97.1  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.113765  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  55.56 
 
 
66 aa  96.3  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  59.38 
 
 
66 aa  96.3  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1060  ribosomal protein L31  59.09 
 
 
71 aa  96.7  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431965  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  57.58 
 
 
70 aa  95.5  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  55.7 
 
 
79 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0887  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 
75 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  55.7 
 
 
79 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  62.5 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  8.02115e-12  hitchhiker  6.1454e-09 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 
72 aa  94.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  53.42 
 
 
75 aa  94.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  2.64126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  55.71 
 
 
70 aa  94.7  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  59.38 
 
 
70 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  60.94 
 
 
71 aa  94.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2420  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.534743  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  51.35 
 
 
115 aa  94.4  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  1.40602e-06  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  59.09 
 
 
70 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  53.42 
 
 
75 aa  94.4  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.43362e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 
70 aa  93.6  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  47.83 
 
 
120 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  59.09 
 
 
71 aa  92.8  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  57.58 
 
 
76 aa  92.8  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4340  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 
74 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.062409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.31599e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 
71 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  57.58 
 
 
70 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 
70 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  59.38 
 
 
71 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 
68 aa  92  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  54.41 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  52.05 
 
 
75 aa  91.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  4.14614e-05  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
66 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 
82 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 
68 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  58.73 
 
 
76 aa  90.9  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 
75 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.10329e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  55.38 
 
 
73 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  56.06 
 
 
75 aa  90.1  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
70 aa  90.1  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  55.38 
 
 
70 aa  90.1  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1786  ribosomal protein L31  57.58 
 
 
69 aa  90.5  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109536  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  53.52 
 
 
86 aa  90.5  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
70 aa  90.1  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  52.38 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  60.94 
 
 
71 aa  90.1  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  50 
 
 
72 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  56.25 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  2.5459e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  57.14 
 
 
73 aa  90.1  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  3.94944e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  58.46 
 
 
68 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  3.50095e-10  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0323  ribosomal protein L31  60.61 
 
 
69 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.100308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  55.38 
 
 
70 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1750  50S ribosomal protein L31  62.3 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45187  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 
70 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 
70 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4342  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 
70 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  54.69 
 
 
67 aa  89.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4312  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 
70 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 
70 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 
70 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  59.09 
 
 
74 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 
70 aa  88.6  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 
70 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>