More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04650 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  71.4 
 
 
512 aa  682  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.50828e-07 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  71.1 
 
 
540 aa  661  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 
496 aa  989  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  8.95838e-05 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  42.74 
 
 
487 aa  382  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.22476e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  40.68 
 
 
494 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  39.08 
 
 
492 aa  346  6e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  40.95 
 
 
495 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  39.71 
 
 
482 aa  340  5e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  39.09 
 
 
479 aa  321  2e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.97319e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  39.09 
 
 
479 aa  321  2e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  39.09 
 
 
479 aa  321  2e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74922e-05 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  39.09 
 
 
479 aa  321  2e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  39.16 
 
 
477 aa  321  2e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  39.09 
 
 
479 aa  321  2e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  38.95 
 
 
477 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  38.95 
 
 
477 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  38.95 
 
 
477 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  39.16 
 
 
477 aa  317  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  37.29 
 
 
483 aa  315  1e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  37.29 
 
 
483 aa  315  1e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  38.19 
 
 
483 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  37.74 
 
 
484 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  37.74 
 
 
484 aa  310  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  37.74 
 
 
484 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  37.4 
 
 
481 aa  309  7e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  38.12 
 
 
477 aa  305  2e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  37.42 
 
 
483 aa  297  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  36.48 
 
 
480 aa  296  6e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  39.25 
 
 
483 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  39.25 
 
 
483 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.98464e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  39.25 
 
 
483 aa  295  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  39.25 
 
 
483 aa  295  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  39.25 
 
 
483 aa  295  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.24112e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  39.25 
 
 
483 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.50129e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  39.25 
 
 
483 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  39.25 
 
 
483 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  6.90231e-05  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  39.52 
 
 
483 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  39.52 
 
 
483 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  39.52 
 
 
483 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  39.52 
 
 
483 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  39.52 
 
 
483 aa  293  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  38.16 
 
 
483 aa  291  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  37.94 
 
 
483 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  33.2 
 
 
483 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  34.02 
 
 
481 aa  245  1e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  31.81 
 
 
479 aa  241  3e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0844  sodium/panthothenate symporter  27.07 
 
 
444 aa  180  5e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  26.46 
 
 
492 aa  131  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.06 
 
 
504 aa  128  2e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  27.4 
 
 
520 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.28 
 
 
493 aa  120  5e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.15 
 
 
533 aa  120  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  26.13 
 
 
489 aa  120  8e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  26.09 
 
 
500 aa  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  27.52 
 
 
474 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  26.92 
 
 
489 aa  119  1e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  24.15 
 
 
513 aa  119  1e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  25.92 
 
 
489 aa  119  2e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.22 
 
 
482 aa  118  2e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  26.07 
 
 
484 aa  118  2e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  24.55 
 
 
508 aa  115  2e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  6.64536e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  26.53 
 
 
506 aa  115  2e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.6 
 
 
533 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  26.53 
 
 
506 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  26.22 
 
 
525 aa  115  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  26.41 
 
 
544 aa  113  7e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  25.87 
 
 
491 aa  112  1e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  24.75 
 
 
528 aa  113  1e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.15 
 
 
533 aa  112  1e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.3 
 
 
533 aa  112  2e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1847  Na+/solute symporter  26.26 
 
 
543 aa  110  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.04 
 
 
496 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  26.31 
 
 
512 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  26.31 
 
 
512 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  25.47 
 
 
494 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  24.19 
 
 
488 aa  107  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.25 
 
 
524 aa  107  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  25 
 
 
494 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  24.45 
 
 
493 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  24.45 
 
 
492 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.71 
 
 
504 aa  107  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  2.18485e-05 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.51 
 
 
489 aa  106  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  26.49 
 
 
498 aa  106  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3158  Na+/solute symporter  24 
 
 
507 aa  106  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  25.89 
 
 
479 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  24.45 
 
 
493 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  24.85 
 
 
489 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  24.95 
 
 
489 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  26.02 
 
 
529 aa  106  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  24.42 
 
 
553 aa  106  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  24.45 
 
 
493 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  24.45 
 
 
492 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  25.68 
 
 
494 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1432  Na+/solute symporter  25.41 
 
 
495 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  25.35 
 
 
495 aa  104  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  25.1 
 
 
536 aa  104  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  26.15 
 
 
492 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  23.05 
 
 
492 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  4.18657e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  27.21 
 
 
530 aa  103  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  24.58 
 
 
492 aa  103  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.5968e-06  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>