12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04300 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04300  Ferric reductase like transmembrane component  100 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  normal  0.0690521 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17890  predicted membrane protein  38.57 
 
 		 223 aa  131  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0780297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05630  hypothetical protein  39.41 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.502408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1591  hypothetical protein  40.18 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174735 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1004  hypothetical protein  34.19 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.222675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18520  hypothetical protein  36.89 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20890  predicted membrane protein  34.48 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1102  hypothetical protein  29 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000717083  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1182  hypothetical protein  34.32 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000961119  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3048  membrane protein-like protein  38.34 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1013  hypothetical protein  32.54 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000440663  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00240  hypothetical protein  32 
 
 		 343 aa  52  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336169 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>