56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04260 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  100 
 
 		 465 aa  946    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  37.7 
 
 		 811 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  33.94 
 
 		 532 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  38.71 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  30.05 
 
 		 330 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  39.46 
 
 		 750 aa  96.3  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  35.2 
 
 		 550 aa  94.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  29.12 
 
 		 613 aa  93.6  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  29.45 
 
 		 651 aa  93.6  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 602 aa  93.6  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  32.94 
 
 		 807 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  32.22 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  33.54 
 
 		 377 aa  89  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  37.86 
 
 		 512 aa  89  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  34.04 
 
 		 440 aa  87  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  28.81 
 
 		 573 aa  87  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  35.85 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  34.57 
 
 		 552 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  35.95 
 
 		 502 aa  83.2  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  39.33 
 
 		 592 aa  80.5  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  36.49 
 
 		 757 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  29.21 
 
 		 891 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  31.61 
 
 		 2495 aa  77.8  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  35.43 
 
 		 578 aa  77  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  34.34 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  25.89 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1557 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  36.09 
 
 		 1527 aa  70.9  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  34.9 
 
 		 753 aa  70.1  0.00000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  33.33 
 
 		 302 aa  69.7  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 342 aa  69.3  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  32.67 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  31.58 
 
 		 737 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  32.28 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  32.56 
 
 		 697 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2299  hypothetical protein  35.25 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  27.44 
 
 		 1732 aa  63.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  32.89 
 
 		 1131 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  32.89 
 
 		 1131 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.55 
 
 		 762 aa  59.7  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  29.14 
 
 		 589 aa  57.4  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  40 
 
 		 203 aa  56.6  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  30.23 
 
 		 817 aa  55.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  30.54 
 
 		 316 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  27.42 
 
 		 2821 aa  53.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  27.27 
 
 		 350 aa  51.6  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  25.32 
 
 		 587 aa  50.4  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1355  hypothetical protein  31.29 
 
 		 532 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0180624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  30.21 
 
 		 1363 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.22 
 
 		 339 aa  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6704  hypothetical protein  25.51 
 
 		 325 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.0763061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1410  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1025 aa  47.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0859  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.62 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000303579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1411  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1002 aa  45.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1409  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1009 aa  44.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0535  YG repeat-containing cell wall-associated hydrolase  31.34 
 
 		 292 aa  43.5  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>