148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04170 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 293 aa  611  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  85.67 
 
 		 293 aa  502  1e-141  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  46.74 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  37.72 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 		 292 aa  205  8e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 		 291 aa  168  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  33.61 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  34.36 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  34.94 
 
 		 297 aa  159  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.25 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  33.99 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  34.58 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  32.8 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  35.93 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  32.53 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  34.29 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  35.12 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  33.93 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  31.88 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  30.34 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  32.51 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  34.71 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  33.47 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  30.77 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  30.28 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  35.78 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  32.78 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  29.96 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  34.8 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  30.18 
 
 		 332 aa  119  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  28.27 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  31.91 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 293 aa  116  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  34.08 
 
 		 321 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  28.27 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  29.64 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  29.41 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.02 
 
 		 257 aa  99.8  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  27.7 
 
 		 388 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 373 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 399 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 377 aa  93.6  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 390 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  31.68 
 
 		 409 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 402 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  25 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2062  putative methyltransferase, or Fe-S oxidoreductase  26.63 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6809  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0385  hypothetical protein  26.63 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4901  radical SAM family protein  26.13 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1179  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.25 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.846685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3408  radical SAM family protein  26.13 
 
 		 473 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2201  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.63 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 489 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20660  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  25.24 
 
 		 470 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2133  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.22 
 
 		 473 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0273985  normal  0.585786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  25.47 
 
 		 476 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1050  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 473 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0795903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  22.01 
 
 		 476 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4283  radical SAM family protein  22.22 
 
 		 480 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1053  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.22 
 
 		 473 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  27.74 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1014  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  28.92 
 
 		 600 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0692  radical SAM family protein  21.78 
 
 		 473 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346694  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1171  radical SAM domain-containing protein  21.78 
 
 		 473 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.397655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1147  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  21.78 
 
 		 473 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125383  normal  0.546782 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 520 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 461 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  20.78 
 
 		 476 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  25.49 
 
 		 495 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0774  ELP3 component of the RNA polymerase II complex  23.77 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000160735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 474 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0455  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.54 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.7 
 
 		 474 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 429 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.66 
 
 		 478 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1924  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  28.43 
 
 		 612 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>