More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04070 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1032 aa  2085    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  37.91 
 
 		 1402 aa  550  1e-155  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  43.22 
 
 		 831 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  43.26 
 
 		 684 aa  413  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.83 
 
 		 961 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  36.6 
 
 		 685 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  37.44 
 
 		 1493 aa  352  3e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  40.43 
 
 		 557 aa  348  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  41.7 
 
 		 789 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  39.12 
 
 		 489 aa  317  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1877 aa  296  1e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 976 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  41.08 
 
 		 490 aa  288  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  41.08 
 
 		 490 aa  287  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1037 aa  270  8.999999999999999e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.28 
 
 		 865 aa  266  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  43.56 
 
 		 393 aa  264  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  40.22 
 
 		 448 aa  262  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  40.98 
 
 		 425 aa  260  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.4 
 
 		 528 aa  254  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  41.97 
 
 		 464 aa  254  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  31.85 
 
 		 679 aa  252  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  31.47 
 
 		 680 aa  245  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  39.55 
 
 		 380 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.55 
 
 		 380 aa  224  7e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  25.36 
 
 		 1200 aa  221  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  29.85 
 
 		 961 aa  221  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.46 
 
 		 392 aa  220  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1366 aa  220  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  28.31 
 
 		 693 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  33.73 
 
 		 509 aa  210  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  33.73 
 
 		 509 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  33.73 
 
 		 509 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.53 
 
 		 341 aa  209  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  33.73 
 
 		 509 aa  209  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  25.73 
 
 		 1044 aa  208  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.73 
 
 		 512 aa  206  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  36.53 
 
 		 305 aa  204  5e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  26.69 
 
 		 1078 aa  204  8e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 		 1430 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  25.56 
 
 		 1200 aa  201  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  42.57 
 
 		 380 aa  201  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.38 
 
 		 346 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  42.8 
 
 		 416 aa  198  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.34 
 
 		 798 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.37 
 
 		 342 aa  193  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  39.46 
 
 		 376 aa  190  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  38.83 
 
 		 376 aa  189  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.13 
 
 		 318 aa  188  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  30.92 
 
 		 591 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.83 
 
 		 359 aa  187  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  37.25 
 
 		 505 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04080  TPR repeat-containing protein  46.45 
 
 		 336 aa  183  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.751374  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1002 aa  184  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  36.54 
 
 		 373 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.2 
 
 		 316 aa  182  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.72 
 
 		 487 aa  181  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  36.36 
 
 		 373 aa  179  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.19 
 
 		 811 aa  174  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  29.02 
 
 		 985 aa  172  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.25 
 
 		 2413 aa  171  4e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  32.28 
 
 		 523 aa  171  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  36.36 
 
 		 331 aa  171  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  36.69 
 
 		 271 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  34.68 
 
 		 331 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  34.01 
 
 		 331 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  34.01 
 
 		 331 aa  166  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.92 
 
 		 343 aa  165  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.97 
 
 		 325 aa  164  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  34.97 
 
 		 399 aa  164  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  37.97 
 
 		 325 aa  164  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  36.86 
 
 		 358 aa  163  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0434  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 464 aa  162  4e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  37.22 
 
 		 325 aa  161  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  39.04 
 
 		 267 aa  160  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  36.9 
 
 		 285 aa  160  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2630  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.13 
 
 		 416 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0395405 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  36.84 
 
 		 327 aa  159  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.6 
 
 		 971 aa  157  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2885  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.17 
 
 		 593 aa  156  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.048224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  33.01 
 
 		 348 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.89 
 
 		 890 aa  154  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  37.56 
 
 		 838 aa  153  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  44.33 
 
 		 274 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  38.53 
 
 		 256 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  40.24 
 
 		 301 aa  152  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  38.22 
 
 		 303 aa  152  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  28.76 
 
 		 536 aa  150  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  33.53 
 
 		 971 aa  150  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  39.09 
 
 		 235 aa  150  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1281 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  37.45 
 
 		 329 aa  149  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  41.92 
 
 		 255 aa  149  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  34.88 
 
 		 482 aa  149  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  33.46 
 
 		 303 aa  148  5e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  45.68 
 
 		 185 aa  147  9e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.07 
 
 		 270 aa  146  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1951  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 705 aa  146  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0868123  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  36.49 
 
 		 552 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 252 aa  141  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>