More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03410 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03410  DNA replication protein  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.896278  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1046  IstB ATP binding domain-containing protein  43.15 
 
 
252 aa  227  1e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  42.98 
 
 
259 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  42.98 
 
 
259 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1360  IstB ATP binding domain-containing protein  42.68 
 
 
245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2292  IstB domain protein ATP-binding protein  46.64 
 
 
254 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2088  IstB domain protein ATP-binding protein  46.64 
 
 
254 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0259  IstB domain protein ATP-binding protein  46.64 
 
 
254 aa  217  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0131  IstB domain protein ATP-binding protein  46.19 
 
 
254 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0506  IstB domain protein ATP-binding protein  45.99 
 
 
271 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1555  IstB domain protein ATP-binding protein  45.99 
 
 
271 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1508  IstB domain protein ATP-binding protein  46.96 
 
 
257 aa  202  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.305327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1327  IstB domain protein ATP-binding protein  45.15 
 
 
259 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0118  IstB domain protein ATP-binding protein  41.35 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1082  IstB domain protein ATP-binding protein  41.35 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0856572  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4929  IstB ATP binding domain-containing protein  39.11 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155263  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5107  IstB ATP binding domain-containing protein  39.11 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269436  normal  0.115979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1513  IstB domain protein ATP-binding protein  43.88 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3692  IstB domain protein ATP-binding protein  43.88 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3059  IstB domain protein ATP-binding protein  43.88 
 
 
259 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1458  IstB-like ATP-binding protein  39.48 
 
 
285 aa  197  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0289  IstB-like ATP-binding protein  38.68 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0645  IstB-like ATP-binding protein  38.68 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0663  IstB-like ATP-binding protein  38.68 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00126088  hitchhiker  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2240  IstB-like ATP-binding protein  38.68 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0212724 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0042  IS21 family transposition helper protein  40.09 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.932139  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0018  IS21 family transposition helper protein  40.09 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0341022  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  40.09 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  40.09 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  40.09 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  40.09 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  40.09 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6915  IstB ATP binding domain-containing protein  40.4 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4701  IstB ATP binding domain-containing protein  40.4 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.193012  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5533  IstB ATP binding domain-containing protein  40.4 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2451  IstB ATP binding domain-containing protein  40.4 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2797  IstB ATP binding domain-containing protein  40.4 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0058  IS21 family transposition helper protein  39.66 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7012  hypothetical protein  40.4 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3887  IstB ATP binding domain-containing protein  40.4 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1509  IstB ATP binding domain-containing protein  40.4 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1463  IstB ATP binding domain-containing protein  40.4 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0787  IstB domain protein ATP-binding protein  44.3 
 
 
259 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1846  IstB ATP binding domain-containing protein  46.45 
 
 
266 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  0.127228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1705  IstB ATP binding domain-containing protein  46.45 
 
 
266 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5625  IstB ATP binding domain-containing protein  46.45 
 
 
266 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264731  normal  0.669883 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6843  IstB ATP binding domain-containing protein  38.4 
 
 
273 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2537  IstB-like ATP-binding protein  39.66 
 
 
266 aa  188  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3716  IstB ATP binding domain-containing protein  40.33 
 
 
258 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0109  IstB ATP binding domain-containing protein  40.33 
 
 
258 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1008  IstB ATP binding domain-containing protein  40.33 
 
 
258 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.126896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1320  IstB ATP binding domain-containing protein  40.33 
 
 
258 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2855  IstB ATP binding domain-containing protein  40.33 
 
 
258 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1257  IstB ATP binding domain-containing protein  47.31 
 
 
401 aa  183  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.679289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0018  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0056  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0193  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0291  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0832  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0864  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1096  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.338234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1658  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2322  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000340663  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2388  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0695654  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2741  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3014  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.141444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3225  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00938953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3432  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0345153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3607  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.525084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4014  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4270  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4626  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4729  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4768  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5370  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.432722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5576  ISPsy4, transposition helper protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0039  transposase/IS protein  41.99 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498862  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0248  transposase/IS protein  40.77 
 
 
281 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2334  transposase/IS protein  40.77 
 
 
281 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0665572 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0452  transposase/IS protein  40.77 
 
 
281 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0953  transposase/IS protein  40.77 
 
 
281 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.94129  normal  0.0557265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1176  IstB domain protein ATP-binding protein  37.02 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00428449  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1015  IstB domain protein ATP-binding protein  37.02 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.684278  normal  0.112434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1500  IstB domain protein ATP-binding protein  37.02 
 
 
252 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0247434  hitchhiker  0.000108884 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4914  IstB ATP binding domain-containing protein  46.04 
 
 
271 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297532 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7662  transposase/IS protein  41.38 
 
 
279 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0196  transposase/IS protein  41.38 
 
 
278 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2304  IstB domain protein ATP-binding protein  46.08 
 
 
262 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0377  IstB domain protein ATP-binding protein  46.08 
 
 
262 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0019  transposase/IS protein  39.66 
 
 
260 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1969  transposase  43.52 
 
 
262 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1590  transposase  43.52 
 
 
262 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2855  transposase  43.52 
 
 
262 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1025  transposase  43.52 
 
 
262 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97029  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4925  transposase  43.52 
 
 
262 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164593  normal  0.337311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3161  transposase  43.52 
 
 
262 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2581  transposase  43.98 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272524  normal  0.0734737 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  39.84 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  38.79 
 
 
259 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  38.79 
 
 
259 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>