17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02900 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_02900  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  616  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00646507  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1034  hypothetical protein  48.44 
 
 
292 aa  281  7e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  45.89 
 
 
293 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  44.86 
 
 
293 aa  276  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  42.32 
 
 
434 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  38.01 
 
 
424 aa  176  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  32.99 
 
 
294 aa  176  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  35.86 
 
 
423 aa  174  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  2.13226e-08 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  35.42 
 
 
428 aa  166  5e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  27.12 
 
 
423 aa  129  8e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  5.23813e-09  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  25.35 
 
 
283 aa  60.1  4e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  29.45 
 
 
358 aa  55.5  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2454  hypothetical protein  22.54 
 
 
323 aa  53.5  5e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.000139037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2233  hypothetical protein  22.92 
 
 
309 aa  52  1e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  1.07793e-12  hitchhiker  1.13425e-06 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7308  hypothetical protein  23.08 
 
 
288 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  7.49019e-09  hitchhiker  9.83885e-05 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1095  hypothetical protein  27.88 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  22.58 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>