52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02530 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  100 
 
 
377 aa  758    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  47.96 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  31.94 
 
 
532 aa  139  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  41.04 
 
 
330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  36.92 
 
 
502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  35.76 
 
 
2495 aa  130  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  41.38 
 
 
651 aa  127  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  48.53 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  33.91 
 
 
602 aa  118  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  38.62 
 
 
811 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  38.2 
 
 
750 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  38.54 
 
 
613 aa  117  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  34.46 
 
 
454 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  34.63 
 
 
430 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  30.89 
 
 
753 aa  109  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  32.86 
 
 
592 aa  105  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  45.63 
 
 
271 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  33.68 
 
 
550 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  35.92 
 
 
807 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  28.25 
 
 
512 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.78 
 
 
891 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  36.41 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  37.81 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  42.68 
 
 
1732 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  43.84 
 
 
331 aa  93.2  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  33.33 
 
 
434 aa  92.8  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  30.33 
 
 
573 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  35.36 
 
 
757 aa  89.7  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  37.4 
 
 
440 aa  89.7  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  33.54 
 
 
465 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  41.46 
 
 
578 aa  89.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  34.74 
 
 
817 aa  86.7  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  55.26 
 
 
203 aa  82.4  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  35.4 
 
 
552 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  32.46 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  32.6 
 
 
1131 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  32.6 
 
 
1131 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  32.04 
 
 
697 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.54 
 
 
762 aa  76.3  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.8 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  29 
 
 
1557 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  27.43 
 
 
737 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.45 
 
 
339 aa  60.5  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  31.46 
 
 
2821 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  22.56 
 
 
589 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  23.79 
 
 
1363 aa  52  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  27.88 
 
 
890 aa  51.2  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  26.42 
 
 
1527 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  25.91 
 
 
587 aa  47  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.56 
 
 
268 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  23.75 
 
 
1514 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0544  YG repeat-containing glycosyl hydrolase  28.07 
 
 
1475 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>