125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  100 
 
 
168 aa  347  7e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  53.66 
 
 
167 aa  207  8e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.73643e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0685  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  44.51 
 
 
167 aa  165  3e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.957986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.83 
 
 
195 aa  82.8  2e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.86 
 
 
197 aa  80.5  9e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  28.06 
 
 
192 aa  75.1  4e-13  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  28.06 
 
 
192 aa  75.1  4e-13  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  28.17 
 
 
200 aa  73.6  1e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  28.19 
 
 
177 aa  72.8  2e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  27.86 
 
 
176 aa  70.5  1e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.97 
 
 
215 aa  67.8  7e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.53 
 
 
160 aa  67.8  8e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  30.83 
 
 
180 aa  67.4  8e-11  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  28.38 
 
 
178 aa  67  1e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  32.71 
 
 
180 aa  67.4  1e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.83 
 
 
186 aa  66.6  1e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  30.28 
 
 
180 aa  66.2  2e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.93 
 
 
189 aa  66.6  2e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  26.67 
 
 
186 aa  66.6  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  27.14 
 
 
176 aa  66.2  2e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.19 
 
 
186 aa  65.9  3e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  30.83 
 
 
181 aa  65.1  4e-10  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.06 
 
 
192 aa  65.5  4e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  31.54 
 
 
149 aa  65.1  4e-10  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  25.19 
 
 
209 aa  65.5  4e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  31.15 
 
 
149 aa  65.1  5e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  25.19 
 
 
188 aa  64.3  7e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  26.62 
 
 
178 aa  63.5  1e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.9 
 
 
185 aa  63.2  1e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  27.67 
 
 
194 aa  62.4  3e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.86 
 
 
190 aa  62.4  3e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  30.07 
 
 
177 aa  62  4e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  32.19 
 
 
186 aa  62  4e-09  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.4 
 
 
176 aa  61.6  5e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  25.81 
 
 
152 aa  61.6  5e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  26.67 
 
 
185 aa  61.6  5e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  28.66 
 
 
189 aa  61.6  5e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.37 
 
 
180 aa  61.2  7e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  26.92 
 
 
183 aa  60.5  1e-08  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.41 
 
 
185 aa  59.7  2e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  27.14 
 
 
185 aa  59.7  2e-08  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.86 
 
 
190 aa  59.7  2e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.23527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  26.36 
 
 
185 aa  58.9  4e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  25.71 
 
 
195 aa  58.2  5e-08  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  26.85 
 
 
182 aa  58.5  5e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.65 
 
 
180 aa  57.8  7e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  26.52 
 
 
189 aa  57.4  8e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  25.18 
 
 
180 aa  57.4  8e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  25.31 
 
 
208 aa  57.4  9e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  27.91 
 
 
180 aa  57  1e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  29.36 
 
 
162 aa  57  1e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  26.49 
 
 
165 aa  56.6  1e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.12 
 
 
186 aa  57  1e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  4.89831e-08 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  28 
 
 
194 aa  57  1e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.28 
 
 
194 aa  57  1e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  26.28 
 
 
195 aa  56.2  2e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  23.81 
 
 
192 aa  55.8  3e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  26.54 
 
 
199 aa  54.7  6e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.23 
 
 
186 aa  54.3  7e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.41 
 
 
193 aa  53.9  1e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5343  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.56 
 
 
157 aa  53.5  1e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  26.95 
 
 
188 aa  53.9  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.95 
 
 
194 aa  53.9  1e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  25.16 
 
 
205 aa  53.1  2e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  23.81 
 
 
184 aa  52.8  2e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  4.40007e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  24.11 
 
 
185 aa  52.8  2e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
186 aa  53.1  2e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.41 
 
 
225 aa  53.1  2e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  30.3 
 
 
190 aa  52.8  2e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  27.7 
 
 
200 aa  52  4e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  5.00824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  26.03 
 
 
188 aa  51.2  6e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.64 
 
 
159 aa  51.2  7e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  27.81 
 
 
186 aa  51.2  7e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.03 
 
 
180 aa  50.4  1e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  24.64 
 
 
190 aa  49.7  2e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  24.39 
 
 
204 aa  49.7  2e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 
190 aa  49.7  2e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  24.84 
 
 
202 aa  48.9  3e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  27.21 
 
 
174 aa  48.1  5e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  27.59 
 
 
161 aa  47.8  8e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.09 
 
 
215 aa  47.8  8e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  27.21 
 
 
216 aa  47.4  9e-05  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  7.09652e-06 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.53 
 
 
189 aa  47.4  9e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.28 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.38 
 
 
215 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.64 
 
 
189 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  24.5 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  26.53 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  27.64 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.86 
 
 
190 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  25.51 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  25.51 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.71 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  25.51 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  27.73 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  26.61 
 
 
244 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  21.49 
 
 
207 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.04 
 
 
192 aa  45.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  24.04 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  24.49 
 
 
189 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>