More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02040 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  100 
 
 		 437 aa  893    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  68.05 
 
 		 435 aa  611  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  68.51 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0111  dihydropteroate synthase  37.83 
 
 		 490 aa  278  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.119932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  50.75 
 
 		 291 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  51.13 
 
 		 316 aa  246  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  49.03 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  48.26 
 
 		 282 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  48.26 
 
 		 282 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  49.03 
 
 		 282 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  48.26 
 
 		 282 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  48.26 
 
 		 282 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  48.26 
 
 		 282 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  48.26 
 
 		 282 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  48.26 
 
 		 282 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  49.03 
 
 		 282 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  48.26 
 
 		 282 aa  241  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  49.03 
 
 		 282 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  48.26 
 
 		 282 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 278 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  48.65 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  45.95 
 
 		 277 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  47.1 
 
 		 282 aa  237  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  47.37 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2187  dihydropteroate synthase  50.59 
 
 		 289 aa  236  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.999142  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  49.6 
 
 		 265 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  49.2 
 
 		 265 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2625  dihydropteroate synthase  47.23 
 
 		 286 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 		 277 aa  231  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  45.59 
 
 		 278 aa  230  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  46.74 
 
 		 279 aa  229  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0210  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 		 299 aa  227  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  46.77 
 
 		 287 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  42.69 
 
 		 277 aa  226  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  42.69 
 
 		 277 aa  226  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2618  dihydropteroate synthase  47.39 
 
 		 292 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.103274  normal  0.519468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  47.31 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0396  dihydropteroate synthase  52.59 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2022  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 313 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 		 283 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  42.69 
 
 		 277 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  47.31 
 
 		 283 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  48.3 
 
 		 281 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  46.83 
 
 		 298 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 276 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  42.96 
 
 		 282 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  44.7 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 		 272 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  44.24 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 		 283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 		 280 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2851  dihydropteroate synthase  45.55 
 
 		 293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.668337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 		 279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0982  dihydropteroate synthase  52.4 
 
 		 278 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  46.72 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 290 aa  220  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2610  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 		 283 aa  220  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  43.63 
 
 		 277 aa  220  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  45.21 
 
 		 400 aa  220  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  44.02 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  43.63 
 
 		 277 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4924  dihydropteroate synthase  46.04 
 
 		 278 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654969 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 275 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  42.44 
 
 		 280 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  47.31 
 
 		 413 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  44.28 
 
 		 275 aa  216  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 		 286 aa  216  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  47.88 
 
 		 278 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 		 288 aa  216  7e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4440  dihydropteroate synthase  46.49 
 
 		 299 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  43.65 
 
 		 259 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  43.23 
 
 		 277 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  40.94 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 		 283 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0817  dihydropteroate synthase  45.65 
 
 		 299 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  46.44 
 
 		 283 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  47.39 
 
 		 297 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1298  dihydropteroate synthase  45.65 
 
 		 299 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  47.49 
 
 		 278 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  42.32 
 
 		 277 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  42.48 
 
 		 284 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  41.57 
 
 		 277 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  45.15 
 
 		 276 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  44.49 
 
 		 307 aa  212  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  41.95 
 
 		 277 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  40.96 
 
 		 277 aa  212  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  42.48 
 
 		 277 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  43.54 
 
 		 277 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0816  dihydropteroate synthase  48.48 
 
 		 278 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 		 280 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 		 277 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1175  dihydropteroate synthase  46.49 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1099  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  41.95 
 
 		 277 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>