More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02030 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  100 
 
 
783 aa  1613    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.82 
 
 
750 aa  971    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  68.75 
 
 
759 aa  969    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  52.39 
 
 
654 aa  636    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  64.35 
 
 
682 aa  627  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.8 
 
 
653 aa  627  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  61.46 
 
 
656 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  63.48 
 
 
627 aa  625  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.04 
 
 
685 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.12 
 
 
615 aa  621  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.46 
 
 
651 aa  618  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.36 
 
 
672 aa  617  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.67 
 
 
672 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.96 
 
 
679 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  63.4 
 
 
753 aa  611  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.65 
 
 
684 aa  609  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.81 
 
 
753 aa  609  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.94 
 
 
639 aa  607  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.15 
 
 
630 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.29 
 
 
614 aa  598  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.12 
 
 
687 aa  602  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.95 
 
 
611 aa  600  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  60.78 
 
 
689 aa  599  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  59.01 
 
 
616 aa  595  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.4 
 
 
682 aa  598  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.23 
 
 
676 aa  594  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.98 
 
 
620 aa  592  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.87 
 
 
651 aa  593  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.82 
 
 
607 aa  593  1e-168  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.75 
 
 
635 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.04 
 
 
671 aa  594  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.1 
 
 
640 aa  588  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  58.69 
 
 
665 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.43 
 
 
608 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.32 
 
 
632 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  55.98 
 
 
684 aa  590  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.61 
 
 
645 aa  591  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.87 
 
 
601 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.61 
 
 
601 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.41 
 
 
599 aa  591  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.87 
 
 
637 aa  589  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.16 
 
 
602 aa  591  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.34 
 
 
634 aa  588  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.89 
 
 
610 aa  587  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.37 
 
 
643 aa  586  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.72 
 
 
616 aa  585  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.04 
 
 
662 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.89 
 
 
610 aa  585  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.99 
 
 
669 aa  586  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.1 
 
 
640 aa  585  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.69 
 
 
639 aa  588  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.99 
 
 
630 aa  587  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  51.69 
 
 
639 aa  588  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.35 
 
 
608 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.28 
 
 
639 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.18 
 
 
659 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.45 
 
 
617 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.22 
 
 
671 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.87 
 
 
657 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.17 
 
 
640 aa  584  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.2 
 
 
673 aa  585  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.66 
 
 
648 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  47.29 
 
 
641 aa  585  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.93 
 
 
642 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.23 
 
 
798 aa  581  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  55.88 
 
 
614 aa  579  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  50.41 
 
 
644 aa  579  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.67 
 
 
696 aa  580  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.47 
 
 
643 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  56.24 
 
 
499 aa  580  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.37 
 
 
639 aa  578  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  47.81 
 
 
637 aa  580  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.88 
 
 
604 aa  581  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.2 
 
 
652 aa  580  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.09 
 
 
626 aa  578  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  49.22 
 
 
700 aa  578  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  54.62 
 
 
608 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 
651 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.38 
 
 
638 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  50.24 
 
 
649 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  55.45 
 
 
681 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.17 
 
 
645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  58.06 
 
 
681 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.13 
 
 
669 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.67 
 
 
656 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.93 
 
 
612 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.25 
 
 
697 aa  574  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.16 
 
 
638 aa  575  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.25 
 
 
697 aa  574  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.65 
 
 
638 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.57 
 
 
635 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.83 
 
 
638 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.14 
 
 
743 aa  575  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.14 
 
 
640 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.28 
 
 
636 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  56.82 
 
 
764 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.13 
 
 
671 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.77 
 
 
643 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  58.87 
 
 
633 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.64 
 
 
656 aa  572  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>