262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02000 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  100 
 
 
139 aa  260  6e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  70.92 
 
 
141 aa  187  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  68.09 
 
 
141 aa  185  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  49.64 
 
 
138 aa  124  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  50.35 
 
 
282 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  50.35 
 
 
282 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  50.35 
 
 
282 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  50.35 
 
 
282 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  50.35 
 
 
282 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  50.35 
 
 
262 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  49.65 
 
 
282 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  49.65 
 
 
282 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  49.29 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  50.36 
 
 
268 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  47.86 
 
 
142 aa  110  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  47.22 
 
 
278 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  47.22 
 
 
278 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  48.94 
 
 
142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  47.48 
 
 
142 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  47.86 
 
 
268 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  46.48 
 
 
143 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  47.14 
 
 
269 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  43.26 
 
 
265 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  43.26 
 
 
265 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2052  TOBE domain protein  47.52 
 
 
142 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  43.97 
 
 
141 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  47.52 
 
 
142 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  44.22 
 
 
270 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  44.22 
 
 
270 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  45.39 
 
 
141 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  42.55 
 
 
268 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  46.81 
 
 
276 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  42.55 
 
 
262 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  42.55 
 
 
262 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  46.1 
 
 
141 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  46.81 
 
 
141 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  45 
 
 
267 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  46.48 
 
 
142 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  43.26 
 
 
281 aa  100  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  46.1 
 
 
141 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  46.1 
 
 
141 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  46.1 
 
 
141 aa  100  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  45.07 
 
 
281 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  45.07 
 
 
281 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  45.07 
 
 
278 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  43.26 
 
 
141 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  46.1 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1804  ModE family transcriptional regulator  42.14 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00273246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  45.07 
 
 
263 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  43.8 
 
 
270 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  45.77 
 
 
263 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  40.29 
 
 
269 aa  98.2  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3381  TOBE domain protein  41.3 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0288596  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  44.37 
 
 
278 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  46.81 
 
 
141 aa  97.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0738  ModE family transcriptional regulator  44.29 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0391445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3265  TOBE domain protein  41.84 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36964  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  46.81 
 
 
140 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  43.17 
 
 
260 aa  95.9  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  39.29 
 
 
269 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  43.26 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  45.39 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  44.76 
 
 
279 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0246  TOBE domain protein  43.17 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  41.73 
 
 
270 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0242  TOBE domain protein  42.75 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  40.15 
 
 
272 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  43.75 
 
 
177 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  44.06 
 
 
279 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  43.97 
 
 
142 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1482  molybdenum-pterin binding protein  40.56 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0617584  hitchhiker  0.00282215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 
270 aa  92  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  41.13 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  42.14 
 
 
278 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  45.71 
 
 
269 aa  91.3  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  41.1 
 
 
269 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  36.88 
 
 
274 aa  90.9  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  41.84 
 
 
276 aa  90.9  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
263 aa  90.1  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3905  TOBE domain-containing protein  44.6 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  36.88 
 
 
257 aa  88.6  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3475  molybdenum-pterin binding protein  43.26 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  36.88 
 
 
263 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  37.59 
 
 
263 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  37.76 
 
 
261 aa  87  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1436  TOBE domain-containing protein  37.04 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  35.51 
 
 
260 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  39.16 
 
 
263 aa  84.7  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  35.46 
 
 
263 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  34.75 
 
 
263 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  38.57 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  37.14 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  32.86 
 
 
265 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4493  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  42.57 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  34.53 
 
 
267 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  42.14 
 
 
269 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  43.57 
 
 
270 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  60 
 
 
67 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  32.37 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>