More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  81.12 
 
 
233 aa  403  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  70.39 
 
 
233 aa  350  8.999999999999999e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  65.52 
 
 
234 aa  324  6e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  63.52 
 
 
233 aa  319  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  63.52 
 
 
233 aa  319  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  58.37 
 
 
233 aa  300  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  59.66 
 
 
233 aa  297  8e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  59.48 
 
 
234 aa  296  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  60.17 
 
 
234 aa  296  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  57.51 
 
 
233 aa  294  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  59.23 
 
 
233 aa  291  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  57.51 
 
 
233 aa  291  6e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  58.8 
 
 
233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  54.94 
 
 
236 aa  280  2e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  54.11 
 
 
236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  56.77 
 
 
248 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  51.07 
 
 
233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  55.66 
 
 
239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  56.77 
 
 
244 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 
233 aa  265  4e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  56.33 
 
 
244 aa  264  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  54.11 
 
 
236 aa  258  4e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  52.89 
 
 
244 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  53.88 
 
 
238 aa  254  6e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  52.86 
 
 
254 aa  252  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  52.86 
 
 
240 aa  252  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.63 
 
 
245 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  54.59 
 
 
253 aa  250  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  52.21 
 
 
251 aa  250  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  53.78 
 
 
236 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  53.05 
 
 
244 aa  249  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  51.77 
 
 
235 aa  249  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  51.29 
 
 
236 aa  248  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.19 
 
 
253 aa  248  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  52 
 
 
244 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  53.33 
 
 
236 aa  247  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  51.95 
 
 
234 aa  246  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  53.3 
 
 
238 aa  247  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  50.22 
 
 
240 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  52.91 
 
 
245 aa  242  3e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  51.3 
 
 
248 aa  242  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  47.19 
 
 
232 aa  241  9e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  48.92 
 
 
236 aa  236  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  49.78 
 
 
251 aa  235  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  51.98 
 
 
241 aa  235  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  50.86 
 
 
235 aa  234  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  51.12 
 
 
245 aa  234  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  45.3 
 
 
604 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  47.62 
 
 
232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  49.13 
 
 
243 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  51.75 
 
 
240 aa  232  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  45.02 
 
 
232 aa  232  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  50.66 
 
 
238 aa  231  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  51.34 
 
 
241 aa  229  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  51.12 
 
 
235 aa  228  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 
345 aa  228  9e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  48.43 
 
 
245 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  51.1 
 
 
250 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  51.46 
 
 
234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  51.94 
 
 
234 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  51.94 
 
 
234 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  46.38 
 
 
235 aa  218  5e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.61 
 
 
233 aa  216  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  52.29 
 
 
230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.74 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  46.78 
 
 
252 aa  210  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  50 
 
 
243 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  45.81 
 
 
234 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47.58 
 
 
231 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  45.81 
 
 
234 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.45 
 
 
234 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  46.02 
 
 
234 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.45 
 
 
234 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.36 
 
 
226 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  47 
 
 
220 aa  206  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.25 
 
 
225 aa  204  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0133  ABC Transporter  43.16 
 
 
300 aa  202  3e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.49 
 
 
228 aa  202  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.42 
 
 
230 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
246 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 
229 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  46.12 
 
 
242 aa  199  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  44.4 
 
 
239 aa  198  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  45.7 
 
 
230 aa  198  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.87 
 
 
230 aa  198  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.25 
 
 
225 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  44.8 
 
 
232 aa  197  9e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.08 
 
 
235 aa  197  9e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  43.84 
 
 
225 aa  197  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  47.6 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  46.58 
 
 
228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  44.83 
 
 
234 aa  196  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
250 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 
235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.78 
 
 
229 aa  195  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.48 
 
 
230 aa  194  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>