228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01690 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
291 aa  608  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  46.48 
 
 
302 aa  268  7e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  46.64 
 
 
352 aa  258  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  33.8 
 
 
270 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  31 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  28.42 
 
 
275 aa  122  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  31.49 
 
 
273 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  28.92 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  30.59 
 
 
264 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  29.69 
 
 
263 aa  98.6  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  29.68 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  26.17 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  26.09 
 
 
275 aa  85.5  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  28.33 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  29.74 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  29.95 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  29.05 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  24.55 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  23.05 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  27.88 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  27.4 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  24.02 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  30.99 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  26.16 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  23.31 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  27.37 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  30.81 
 
 
319 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  25.65 
 
 
283 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  27.88 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  23.3 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  25.24 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  27.5 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  30.59 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  26.54 
 
 
268 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.25 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  29.27 
 
 
276 aa  56.6  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  23.33 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  25.1 
 
 
302 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  22.93 
 
 
287 aa  55.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  25.66 
 
 
232 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5925  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.97 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  23.93 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  25 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  54.17 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  24.79 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  33.91 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  26.17 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  31.43 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  26.29 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  31.65 
 
 
274 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0349  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
274 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  28.31 
 
 
287 aa  52.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  19.5 
 
 
295 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  24.79 
 
 
278 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  21.46 
 
 
279 aa  52  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0356  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  29.47 
 
 
240 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  45.45 
 
 
233 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  25.12 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  33.77 
 
 
261 aa  51.6  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.42 
 
 
155 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  25.41 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  27.81 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0057  precorrin-6y C5,15-methyltransferase subunit CbiT  34.15 
 
 
196 aa  50.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  28.66 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  31.37 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  31.93 
 
 
274 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
253 aa  49.3  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 
226 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 
243 aa  48.9  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  19.41 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  27.72 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  30.2 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5457  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 
385 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26285  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  23.46 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  30.88 
 
 
244 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  25.97 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  28.15 
 
 
241 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  31.25 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.68 
 
 
263 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  34.38 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.17 
 
 
279 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  27.72 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  27.72 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  33.04 
 
 
233 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  23.04 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.86 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  39.22 
 
 
219 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  30.09 
 
 
257 aa  47  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  29.67 
 
 
207 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  20.23 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>