58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01460 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01460  predicted HD superfamily hydrolase  100 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0275977  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2818  HDIG domain-containing protein  77.55 
 
 
201 aa  304  5.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0140878 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  63.27 
 
 
771 aa  235  3e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3184  metal dependent phophohydrolase  53.04 
 
 
186 aa  203  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1236  metal dependent phophohydrolase  51.91 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0703  metal dependent phophohydrolase  41.76 
 
 
191 aa  144  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000160771 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1569  metal dependent phophohydrolase  41.76 
 
 
184 aa  144  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0692  metal dependent phophohydrolase  41.21 
 
 
191 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000253532  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2682  metal dependent phosphohydrolase  42.71 
 
 
190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0703847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2783  HDIG domain-containing protein  41.21 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15740  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 
183 aa  121  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4580  metal dependent phosphohydrolase  40.33 
 
 
200 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000627017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1412  metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0296584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0272  metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 
183 aa  118  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00103666  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1221  metal dependent phosphohydrolase  36.76 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3535  metal dependent phosphohydrolase  37.78 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3897  metal dependent phophohydrolase  36.96 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0567621 
 
 
-
 
NC_002936  DET0547  HDIG domain-containing protein  37.16 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2951  metal dependent phosphohydrolase  42.6 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0010  metal dependent phosphohydrolase  41.08 
 
 
190 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3779  metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 
218 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2145  metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 
187 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3414  metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.014123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0422  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3919  metal dependent phophohydrolase  35.68 
 
 
214 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300311  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0723  metal dependent phosphohydrolase  36.22 
 
 
180 aa  111  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3835  metal dependent phophohydrolase  35.14 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_488  HD superfamily hydrolase  38.55 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0853951  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0328  metal dependent phosphohydrolase  34.97 
 
 
217 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2258  metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 
186 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331666  hitchhiker  0.000431176 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1325  metal dependent phosphohydrolase  36.61 
 
 
180 aa  108  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1488  metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 
183 aa  107  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1234  metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 
175 aa  106  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0523  metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 
183 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0279  HDIG domain-containing protein  34.76 
 
 
183 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000148406  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1635  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 
181 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1079  metal dependent phosphohydrolase  40.28 
 
 
196 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0761  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 
185 aa  98.2  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.933081 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1169  metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 
187 aa  98.2  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1228  hypothetical protein  34.97 
 
 
183 aa  97.8  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2011  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000379503  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0027  metal dependent phophohydrolase  35.33 
 
 
184 aa  95.5  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3456  metal dependent phophohydrolase  30.05 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.986512  normal  0.0301443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4403  metal dependent phophohydrolase  28.86 
 
 
213 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.127842  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1352  metal dependent phosphohydrolase  35.79 
 
 
183 aa  91.3  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00103581  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2109  metal dependent phosphohydrolase  32.05 
 
 
185 aa  87.8  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00149234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0145  metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2830  metal dependent phosphohydrolase  35.93 
 
 
193 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3125  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
181 aa  84.7  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0572222 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0463  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1546  metal dependent phophohydrolase  34.44 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5425  metal dependent phophohydrolase  34.36 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0190213 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0373  metal dependent phophohydrolase  34.25 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196484  normal  0.0301256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2252  metal dependent phosphohydrolase  30.56 
 
 
182 aa  79  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0289443  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1422  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1974  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
184 aa  77  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.475926  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1591  hypothetical protein  30.05 
 
 
187 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0374  metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 
184 aa  62  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>