More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01240 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 144 aa  288  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14760  universal stress protein UspA-like protein  40.37 
 
 		 160 aa  106  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0107987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2020  UspA domain protein  38.89 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000426305 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  38.75 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3008  UspA domain protein  32.3 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.396305 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  38.46 
 
 		 297 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  32.03 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  35.66 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  32.88 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  35.1 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  34.46 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  38.1 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  36.3 
 
 		 180 aa  63.5  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  31.82 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  32.45 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  31.82 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  32.45 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  32.45 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  32.45 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  32.45 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  35.1 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  31.17 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  35.66 
 
 		 288 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.77 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  32.64 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  34.51 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  36.73 
 
 		 286 aa  60.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  36 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.88 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.66 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.11 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  30.34 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  33.78 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  34.42 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  33.33 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  34.03 
 
 		 301 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  34.01 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.03 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.01 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.99 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  30.61 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  32.89 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.17 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  33.56 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  32.19 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  28.87 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.05 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  36.3 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.77 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.56 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.03 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  31.08 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  29.58 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  33.57 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  31.94 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.45 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.07 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  31.69 
 
 		 289 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  29.79 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  31.29 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  32.35 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  28 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  33.75 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  31.79 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.25 
 
 		 290 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.89 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2814  UspA domain protein  31.13 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000545655  hitchhiker  0.00186691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  31.58 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  32.17 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.45 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  32 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  29.22 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  35.66 
 
 		 281 aa  52.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  33.33 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.03 
 
 		 307 aa  52  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  32.21 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>