212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01210 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_01210  transposase  100 
 
 
245 aa  512  1e-144  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  40.94 
 
 
253 aa  192  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  40.55 
 
 
253 aa  190  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  38.33 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  35.16 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  35.04 
 
 
258 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  35.29 
 
 
236 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  32.55 
 
 
250 aa  155  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  34.47 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  32.81 
 
 
324 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  35.39 
 
 
324 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  34.43 
 
 
282 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  36.61 
 
 
321 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  35.91 
 
 
319 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  109  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  35.88 
 
 
321 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  36.99 
 
 
326 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  34.34 
 
 
315 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  38.73 
 
 
326 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  36.62 
 
 
325 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  35.8 
 
 
230 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  35.8 
 
 
230 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  36.42 
 
 
230 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  36.62 
 
 
325 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  35 
 
 
321 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  36.05 
 
 
230 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  31.28 
 
 
320 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  37.32 
 
 
334 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  32.96 
 
 
327 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  41.26 
 
 
323 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  32.96 
 
 
321 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  35.98 
 
 
313 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  31.94 
 
 
316 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  36.88 
 
 
321 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  35 
 
 
321 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  35 
 
 
321 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  35 
 
 
321 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  32.63 
 
 
506 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  35 
 
 
327 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  33.13 
 
 
321 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  35.09 
 
 
321 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  35.09 
 
 
321 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  33.73 
 
 
181 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  38.89 
 
 
165 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  30.64 
 
 
221 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  34.3 
 
 
287 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  33.15 
 
 
321 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  32.53 
 
 
312 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  35.33 
 
 
312 aa  99.8  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  37.32 
 
 
160 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  32.8 
 
 
321 aa  99.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  34.08 
 
 
325 aa  99.8  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  34.38 
 
 
318 aa  99.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  36.36 
 
 
319 aa  99  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  33.73 
 
 
289 aa  99  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  35.67 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  36.05 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  32.1 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  32.61 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  32.1 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  34.51 
 
 
336 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  31.72 
 
 
192 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  31.72 
 
 
190 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  30.99 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  31.84 
 
 
333 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  35.88 
 
 
340 aa  95.5  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  32.39 
 
 
316 aa  95.1  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  33.33 
 
 
338 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  32.52 
 
 
323 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  30.21 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  34.29 
 
 
252 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  32.52 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  34.51 
 
 
323 aa  92.8  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  34.97 
 
 
235 aa  92  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  35.81 
 
 
234 aa  92  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  32.88 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  34.51 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  34.48 
 
 
288 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  32.53 
 
 
277 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  32.77 
 
 
232 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  34.48 
 
 
288 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  32.7 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  33.79 
 
 
288 aa  88.6  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  33.57 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  31.06 
 
 
335 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  30.17 
 
 
316 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  32.19 
 
 
233 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  33.33 
 
 
180 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  32.95 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  33.1 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  33.07 
 
 
335 aa  86.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  33.78 
 
 
223 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  35.46 
 
 
323 aa  85.9  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  31.65 
 
 
322 aa  85.5  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  28.65 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  32.85 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  31.33 
 
 
316 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1872  hypothetical protein  37.3 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  34.75 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>