287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00980 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 459 aa  910    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2390  hypothetical protein  36.99 
 
 		 280 aa  130  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.375551 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  72.31 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  50.42 
 
 		 197 aa  97.8  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  77.97 
 
 		 247 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  53.23 
 
 		 146 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  42.71 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  48.39 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  46.38 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  33.85 
 
 		 293 aa  69.7  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 327 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  43.66 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  43.66 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 107 aa  67  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  42.67 
 
 		 262 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  52.54 
 
 		 296 aa  66.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  50 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  43.84 
 
 		 200 aa  65.1  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 268 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 208 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 320 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 176 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 163 aa  61.6  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  43.75 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  39.09 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 115 aa  60.5  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  42.19 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  50 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  42.19 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 108 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  39.29 
 
 		 114 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  32 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  39.29 
 
 		 114 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  29.32 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 		 196 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  35.59 
 
 		 108 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  42.19 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0006  XRE family transcriptional regulator  52 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000100303  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  46.55 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  40.62 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 212 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  28.93 
 
 		 118 aa  56.6  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  42.86 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 374 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 163 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 123 aa  54.7  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 133 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 125 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 189 aa  54.3  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02998  transcriptional regulator PbsX family  44.93 
 
 		 125 aa  53.9  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 242 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 368 aa  53.5  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  31 
 
 		 370 aa  53.5  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 204 aa  53.5  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 206 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  39.68 
 
 		 149 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  32.59 
 
 		 243 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 183 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 137 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  43.1 
 
 		 244 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0978  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 126 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 85 aa  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0860  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 126 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 190 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 229 aa  52.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2005  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.445906  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  38.67 
 
 		 197 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 266 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 141 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  40.38 
 
 		 227 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>