264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00930 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00930  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
173 aa  360  6e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407777  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18130  NADPH-dependent FMN reductase  49.68 
 
 
172 aa  152  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.340395  normal  0.960689 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3468  multimeric flavodoxin WrbA family protein  43.86 
 
 
183 aa  105  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  decreased coverage  0.000563166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18210  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 
177 aa  98.2  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  29.88 
 
 
179 aa  95.5  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2849  NADPH-dependent FMN reductase  48.62 
 
 
192 aa  94.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1139  NADPH-dependent FMN reductase  31.64 
 
 
182 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.628109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2629  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.86 
 
 
344 aa  90.9  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1046  hypothetical protein  39.81 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.882215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  31.89 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0784  NADPH-dependent FMN reductase  40.78 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1584  NADPH-dependent FMN reductase  34.64 
 
 
220 aa  89.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1676  hypothetical protein  45.45 
 
 
200 aa  88.2  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.225095  hitchhiker  0.000000298375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0374  NADPH-dependent FMN reductase  33.54 
 
 
188 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.4772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0772  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  33.72 
 
 
193 aa  86.3  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.806618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1988  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.67 
 
 
321 aa  86.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0292793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1619  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0018  NADPH-dependent FMN reductase  36.97 
 
 
228 aa  85.1  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1381  NADPH-dependent FMN reductase  32.52 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196943  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2738  NADPH-dependent FMN reductase  39.02 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1029  NADPH-dependent FMN reductase  41.67 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.153649  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0671  NADPH-dependent FMN reductase  38.53 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.610211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2213  NADPH-dependent FMN reductase  29.48 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  36.89 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0748  iron-sulfur flavoprotein  31.98 
 
 
195 aa  82  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.203042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  31.02 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  36.17 
 
 
202 aa  80.9  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0449  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.09 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.536624  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2476  NADPH-dependent FMN reductase  33.61 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000689754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  35.51 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  40.4 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  32.82 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0130  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  27.85 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0275  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2330  NADPH-dependent FMN reductase  35.92 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal  0.0193614 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  39.6 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  36.72 
 
 
197 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0521  NADPH-dependent FMN reductase  33.87 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0893  NADPH-dependent FMN reductase  30.94 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  33.56 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  32.06 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  37.62 
 
 
209 aa  77.8  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  36.43 
 
 
197 aa  77.4  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2979  NADPH-dependent FMN reductase  32.39 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.670971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1743  NADPH-dependent FMN reductase  32.77 
 
 
214 aa  77.4  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  39.22 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1442  NADPH-dependent FMN reductase  33.61 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  40.38 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  33.13 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  33.65 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2475  NADPH-dependent FMN reductase  29.27 
 
 
217 aa  77  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.736358  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  28.49 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  32.84 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3857  NADPH-dependent FMN reductase  29.44 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00910864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0413  NADPH-dependent FMN reductase  29.61 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  33.66 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1487  NADPH-dependent FMN reductase  36.75 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.22855  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2272  NADPH-dependent FMN reductase  37.14 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1320  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.654727  normal  0.0975932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3622  NADPH-dependent FMN reductase  35.19 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2659  NADPH-dependent FMN reductase  35.94 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.385785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1486  NADPH-dependent FMN reductase  31.39 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  33.96 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  31.3 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  39.81 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  32.06 
 
 
190 aa  74.3  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1178  NADPH-dependent FMN reductase  35.19 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0303  NADPH-dependent FMN reductase  33.77 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  35.29 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  33.98 
 
 
204 aa  74.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2580  iron-sulfur flavoprotein  32.38 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29861  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1102  iron-sulfur flavoprotein  36.79 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000321891  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  30.72 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  30.53 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3773  NADPH-dependent FMN reductase  27.85 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.65168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1467  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0333  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.1 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  37.25 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  34.38 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  34.65 
 
 
194 aa  72  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  29.21 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  37.38 
 
 
224 aa  72  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1105  NADPH-dependent FMN reductase  31.93 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128897  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0080  NADPH-dependent FMN reductase  37 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0125  NADPH-dependent FMN reductase  32.93 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1799  NADPH-dependent FMN reductase  30.65 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  33.33 
 
 
192 aa  70.9  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.29 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  32.72 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  32.69 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>