80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00890 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00890  CAAX amino terminal protease family  100 
 
 
301 aa  587  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.685827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4306  Abortive infection protein  50 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1444  hypothetical protein  45.32 
 
 
445 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2649  abortive infection protein  35.82 
 
 
307 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161377  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0625  Abortive infection protein  37.3 
 
 
313 aa  99.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02770  Abortive infection protein  28.41 
 
 
301 aa  95.9  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1920  Abortive infection protein  35.02 
 
 
336 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0196  abortive infection protein  27.46 
 
 
317 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000278979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1274  abortive infection protein  40.14 
 
 
316 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1573  CAAX amino terminal protease family protein  30.84 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3767  Abortive infection protein  31.12 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1696  abortive infection protein  37.58 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0423  abortive infection protein  29.52 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.778959  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5617  Abortive infection protein  45.71 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290139  normal  0.0104592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3225  caax amino protease family  35.25 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0048  abortive infection protein  34.02 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4558  abortive infection protein  36.54 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3288  CAAX amino protease  39.29 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469913  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2218  abortive infection protein  40.35 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131275  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2029  caax amino protease family  40.37 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2993  abortive infection protein  28.44 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1518  abortive infection protein  36.07 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.094823  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0624  Abortive infection protein  26.45 
 
 
286 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2156  abortive infection protein  30.77 
 
 
296 aa  62.4  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0114  abortive infection protein  29.87 
 
 
288 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0149587  normal  0.366551 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0892  abortive infection protein  31.41 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1888  abortive infection protein  32.04 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3492  CAAX amino protease  33 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000826843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2862  CAAX amino terminal protease family protein  25.96 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000124869  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2750  hypothetical protein  34.87 
 
 
171 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.810163 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2573  CAAX amino protease  25.96 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000633409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2815  CAAX amino terminal protease family protein  25.96 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000895449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2624  CAAX amino terminal protease family protein  25.96 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000361529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2822  CAAX amino terminal protease family protein  25.96 
 
 
288 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000414877 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2540  CAAX amino protease  25.53 
 
 
288 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000314156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3196  CAAX amino terminal protease family protein  33 
 
 
253 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.573648  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1196  hypothetical protein  31.37 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4079  Abortive infection protein  34.23 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.403936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0284  hypothetical protein  25.47 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000062165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3974  abortive infection protein  26.7 
 
 
282 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3349  abortive infection protein  26.34 
 
 
300 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.323256  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3338  abortive infection protein  26.34 
 
 
300 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207652  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3400  abortive infection protein  26.34 
 
 
300 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4306  Abortive infection protein  28.7 
 
 
290 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1351  abortive infection protein  29.3 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0164067  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0921  abortive infection protein  30.41 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2045  hypothetical protein  27.72 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840035  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28530  CAAX amino terminal protease family  32.14 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.351538  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0990  Abortive infection protein  40.26 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3268  caax amino protease family protein  34.78 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3497  caax amino protease family  51.35 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3573  Abortive infection protein  29.2 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4285  Abortive infection protein  33.33 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2103  abortive infection protein  36.49 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3051  caax amino protease family  28.04 
 
 
211 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0459  Abortive infection protein  32.5 
 
 
269 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00156838 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3057  CAAX amino terminal protease family protein  28.43 
 
 
313 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1073  abortive infection protein  55.56 
 
 
274 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3294  CAAX amino terminal protease family protein  28.43 
 
 
306 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.698402  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2868  Abortive infection protein  31.16 
 
 
303 aa  45.8  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00550305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3235  abortive infection protein  35.29 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.636961 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  31.91 
 
 
420 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1983  Abortive infection protein  37.7 
 
 
227 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00182843  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3329  hypothetical protein  30 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4257  Abortive infection protein  41.03 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2966  abortive infection protein  32.63 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000169626  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2718  Abortive infection protein  29.29 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4749  abortive infection protein  46 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05731  membrane-associated protease  30.85 
 
 
448 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1848  metal-dependent membrane protease  30.85 
 
 
448 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11501  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5653  abortive infection protein  31.82 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.122774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05840  CAAX amino terminal protease family  31.31 
 
 
315 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.472033  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1934  abortive infection protein  31.87 
 
 
225 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0936214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1059  CAAX amino terminal protease family protein  42.11 
 
 
277 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000225986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3357  Abortive infection protein  28.79 
 
 
240 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0335606  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0893  CAAX amino terminal protease family protein (Ste24 endopeptidase)  42.11 
 
 
277 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000636036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0878  CAAX amino terminal protease family protein  42.11 
 
 
270 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0374332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0911  CAAX amino terminal protease family protein  42.11 
 
 
277 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2149  abortive infection protein  32.61 
 
 
254 aa  42.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.336664 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0971  CAAX amino terminal protease family protein  42.11 
 
 
277 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>