More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00710 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 
593 aa  1205    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.09 
 
 
581 aa  582  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  35.54 
 
 
588 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.16 
 
 
577 aa  372  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.07 
 
 
582 aa  369  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  32.77 
 
 
574 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  35.51 
 
 
587 aa  361  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.42 
 
 
574 aa  360  5e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  35.31 
 
 
578 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  35.33 
 
 
579 aa  354  2.9999999999999997e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  35.31 
 
 
578 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  36.94 
 
 
605 aa  351  2e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.9 
 
 
588 aa  350  3e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  34.86 
 
 
576 aa  343  7e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 
579 aa  341  2e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  30.99 
 
 
577 aa  340  5e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  30.99 
 
 
577 aa  340  5e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  34.93 
 
 
577 aa  333  6e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  32.99 
 
 
581 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  33.4 
 
 
579 aa  326  6e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  32.94 
 
 
577 aa  325  1e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.04 
 
 
581 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  35.86 
 
 
579 aa  320  3.9999999999999996e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.46 
 
 
577 aa  319  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  37.1 
 
 
578 aa  316  7e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.77 
 
 
597 aa  314  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.2 
 
 
581 aa  313  3.9999999999999997e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.71 
 
 
589 aa  313  4.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  38.7 
 
 
574 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  32.89 
 
 
611 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  37.24 
 
 
579 aa  310  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.86 
 
 
568 aa  309  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  34.13 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  37.39 
 
 
593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  32.28 
 
 
619 aa  305  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  31.42 
 
 
597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  32.81 
 
 
583 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  32.48 
 
 
592 aa  303  8.000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.92 
 
 
603 aa  300  5e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.21 
 
 
585 aa  299  8e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.85 
 
 
1228 aa  297  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.05 
 
 
581 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.52 
 
 
579 aa  296  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  35.48 
 
 
606 aa  296  8e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  33.11 
 
 
592 aa  296  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.53 
 
 
581 aa  295  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.33 
 
 
577 aa  293  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  32.33 
 
 
584 aa  293  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.88 
 
 
580 aa  292  9e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  32.61 
 
 
638 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  31.95 
 
 
573 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  35.63 
 
 
604 aa  286  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  31.72 
 
 
580 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  34.1 
 
 
607 aa  286  7e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.24 
 
 
573 aa  285  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.87 
 
 
595 aa  283  6.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  35.07 
 
 
609 aa  283  8.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.71 
 
 
571 aa  282  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.32 
 
 
575 aa  280  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.29 
 
 
581 aa  278  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 
573 aa  279  1e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  35.14 
 
 
598 aa  279  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  31.29 
 
 
599 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  31.93 
 
 
608 aa  278  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.38 
 
 
618 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  33.46 
 
 
608 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.62 
 
 
576 aa  276  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.89 
 
 
580 aa  275  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  31.5 
 
 
1194 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  33.73 
 
 
571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  34.03 
 
 
581 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  31.53 
 
 
609 aa  273  7e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  33.9 
 
 
611 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 
566 aa  272  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  33.14 
 
 
642 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  32.61 
 
 
593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.06 
 
 
572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  32.81 
 
 
593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 
618 aa  270  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.33 
 
 
1091 aa  270  5e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  27.64 
 
 
587 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.03 
 
 
574 aa  269  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  27.64 
 
 
587 aa  269  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  33.51 
 
 
588 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  30.96 
 
 
632 aa  269  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.07 
 
 
622 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.31 
 
 
573 aa  267  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.29 
 
 
586 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  30.46 
 
 
573 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
578 aa  268  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  32.57 
 
 
628 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.54 
 
 
585 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  32.11 
 
 
640 aa  267  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.29 
 
 
586 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  32.07 
 
 
585 aa  266  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.63 
 
 
586 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.46 
 
 
586 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.29 
 
 
580 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  30.46 
 
 
586 aa  266  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.46 
 
 
586 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>