20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00590 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00590  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  706    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0235672  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2394  hypothetical protein  35.74 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.339824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0434  hypothetical protein  31.52 
 
 
289 aa  132  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2475  hypothetical protein  33.46 
 
 
277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3034  hypothetical protein  33.86 
 
 
313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1303  hypothetical protein  28.72 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.900215  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1672  hypothetical protein  30.61 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.162701  hitchhiker  0.00245023 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0082  hypothetical protein  31.3 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2722  hypothetical protein  26.99 
 
 
328 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.326392  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0191  hypothetical protein  34.04 
 
 
231 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1827  hypothetical protein  30.89 
 
 
331 aa  106  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.14041  normal  0.116038 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1460  hypothetical protein  29.92 
 
 
319 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250595  normal  0.581069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2545  hypothetical protein  32.8 
 
 
217 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.102425  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0680  hypothetical protein  30.98 
 
 
209 aa  95.9  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.366388 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13560  hypothetical protein  27.48 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06870  hypothetical protein  32.89 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.671903  normal  0.164023 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05360  hypothetical protein  30.06 
 
 
352 aa  59.7  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  24.58 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  29.63 
 
 
286 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  34.67 
 
 
276 aa  42.7  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>