239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00420 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00420  signal peptidase I  100 
 
 
198 aa  400  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379393  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  33.74 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  32.87 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  31.68 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  33.57 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  33.88 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  28.05 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  33.88 
 
 
199 aa  63.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  31.29 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  30.12 
 
 
183 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0764  signal peptidase I  25.84 
 
 
221 aa  61.2  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2140  signal peptidase I  30.19 
 
 
174 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2135  signal peptidase I  27.72 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0591499  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  34.48 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0669  signal peptidase I  32.19 
 
 
189 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000423092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  29.49 
 
 
189 aa  58.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  29.52 
 
 
183 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2062  Signal peptidase I  29.65 
 
 
201 aa  58.5  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  30 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2462  signal peptidase I  29.19 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  32.64 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0858  signal peptidase I  29.08 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  30.82 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  29.79 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0839  signal peptidase I  32.84 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.240301  normal  0.0615193 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  26.62 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1741  signal peptidase I  28 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0400  signal peptidase I  29.85 
 
 
176 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0715  signal peptidase I  29.1 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00052809  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  26.18 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  28.92 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  27.98 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  28.92 
 
 
183 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  28.92 
 
 
183 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  28.92 
 
 
183 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  28.92 
 
 
183 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  28.92 
 
 
183 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0393  signal peptidase I  29.2 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  28.92 
 
 
183 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  30.71 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1059  signal peptidase I  30.5 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  28.92 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1140  signal peptidase I  30.5 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1218  signal peptidase I  30.5 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  27.27 
 
 
189 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  32.37 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  28.92 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1484  signal peptidase I  27.86 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0478  signal peptidase I  28.67 
 
 
177 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0528  signal peptidase I S  28.37 
 
 
178 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  30 
 
 
187 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1295  signal peptidase I  30 
 
 
187 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.309036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0392  signal peptidase I (SPase I)  27.66 
 
 
178 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1039  signal peptidase I  30 
 
 
187 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  30 
 
 
187 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2064  signal peptidase I  29.61 
 
 
186 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0525582  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1183  signal peptidase I  28.57 
 
 
193 aa  55.1  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0459  signal peptidase I S  28.67 
 
 
177 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1037  signal peptidase I  31.65 
 
 
187 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2878  signal peptidase I  32.03 
 
 
183 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.293282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4845  signal peptidase I  28.67 
 
 
177 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  27.89 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  33.33 
 
 
184 aa  54.7  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2663  signal peptidase I  27.86 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.825053  hitchhiker  0.000150203 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3104  Signal peptidase I U  30.92 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3441  signal peptidase I  30.4 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.101353  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  37 
 
 
289 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  30.3 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0553  signal peptidase IB  30.53 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0388  signal peptidase I  28.67 
 
 
178 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.932746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3090  Signal peptidase I U  28.95 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  32.85 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0529  signal peptidase I S  27.66 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  29.05 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2862  signal peptidase I  29.93 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  27.91 
 
 
304 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  30 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0965  signal peptidase I  29.63 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.227628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0984  signal peptidase I  29.63 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.920415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3123  Signal peptidase I U  30.26 
 
 
183 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2884  Signal peptidase I U  30.26 
 
 
183 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0198691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2851  signal peptidase I  30.26 
 
 
183 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.369909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2812  signal peptidase I  30.26 
 
 
183 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3099  Signal peptidase I U  30.26 
 
 
183 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0167599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  29.13 
 
 
179 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3122  Signal peptidase I U  30.26 
 
 
183 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2146  Signal peptidase I U  28.95 
 
 
183 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  31.98 
 
 
243 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  40 
 
 
294 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  27.74 
 
 
173 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  30.56 
 
 
190 aa  52  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  25.87 
 
 
288 aa  51.6  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0913  signal peptidase I  33.58 
 
 
176 aa  51.6  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0872445  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  23.29 
 
 
198 aa  51.2  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1330  thylakoidal processing peptidase  26.35 
 
 
174 aa  51.2  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  23.35 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  25.62 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  34.91 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  37.08 
 
 
284 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1727  signal peptidase I  25.83 
 
 
232 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>