More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00290 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  100 
 
 		 226 aa  453  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  61.5 
 
 		 225 aa  291  5e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  60.09 
 
 		 225 aa  262  4e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  36.28 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  39.15 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  38.36 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  36.8 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  37.67 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  36.99 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  37.72 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  36.12 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  37.72 
 
 		 220 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  34.8 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  34.8 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  37.56 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  34.6 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  37.38 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  32.3 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  34.72 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  35 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  35.02 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  33.51 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  30.84 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  33.64 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  31 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  35.5 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  32.6 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  32.74 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  30.53 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  27.88 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32.59 
 
 		 628 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 		 206 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  31.82 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  29.39 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  31.38 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  30.97 
 
 		 299 aa  92  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  29.44 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  29.63 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  35.11 
 
 		 134 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  29.07 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  33.5 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  35.11 
 
 		 134 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  35.11 
 
 		 134 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  32.89 
 
 		 626 aa  89.4  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  29.96 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  31.28 
 
 		 259 aa  89  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  33.95 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  28 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  32.05 
 
 		 617 aa  88.2  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  30.85 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  31.22 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  30 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  39.42 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  32.73 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  36.15 
 
 		 137 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  29.95 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  31.38 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  30.8 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  29.33 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  30.91 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  32.08 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  24.53 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  28.44 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  30.85 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  31.38 
 
 		 218 aa  85.1  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  31.03 
 
 		 459 aa  84.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  27.93 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  33.67 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  32.6 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  31.48 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  31.7 
 
 		 630 aa  84  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  29.31 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  35.25 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  27.88 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  29.07 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  36.67 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  26.87 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  28.9 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  30.53 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  32.98 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  32.05 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  30.06 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  25.12 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  34.2 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  28.63 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  32.5 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  31.88 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  32.52 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  30.77 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  30.09 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  35.83 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  33.07 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  28.7 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>