More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00010 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
501 aa  1040  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  1.75242e-05  decreased coverage  7.4483e-05 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  51 
 
 
520 aa  514  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  2.22997e-06  hitchhiker  1.4852e-07 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.47 
 
 
506 aa  492  1e-138  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.993036  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  34.21 
 
 
460 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  33 
 
 
457 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  32.59 
 
 
457 aa  255  1e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  32.77 
 
 
449 aa  254  2e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  34.2 
 
 
458 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  32.34 
 
 
500 aa  250  4e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.25 
 
 
480 aa  247  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  31.14 
 
 
446 aa  247  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  31.14 
 
 
446 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  30.94 
 
 
446 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  30.94 
 
 
446 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  30.94 
 
 
446 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  30.94 
 
 
446 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  30.94 
 
 
446 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  31.45 
 
 
440 aa  246  7e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  31.14 
 
 
446 aa  246  1e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  32.38 
 
 
472 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  32.19 
 
 
489 aa  243  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  8.45727e-09  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  35.22 
 
 
442 aa  243  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  31.95 
 
 
492 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  30.94 
 
 
446 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.45 
 
 
453 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  30.26 
 
 
450 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.91 
 
 
509 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  30.46 
 
 
450 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  30.74 
 
 
446 aa  239  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.19 
 
 
470 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.33107e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0045  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.21 
 
 
539 aa  237  4e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
452 aa  237  4e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  5.82235e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 
446 aa  237  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  31.64 
 
 
443 aa  237  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.57 
 
 
458 aa  236  8e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.49 
 
 
454 aa  236  1e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  31.01 
 
 
494 aa  235  1e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  31.54 
 
 
491 aa  235  1e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  33.47 
 
 
448 aa  234  2e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  31.84 
 
 
495 aa  235  2e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  30.36 
 
 
443 aa  234  2e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  31.84 
 
 
495 aa  235  2e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  31.38 
 
 
481 aa  234  2e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.6365e-07  unclonable  1.12062e-05 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  32.12 
 
 
487 aa  234  2e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  31.84 
 
 
495 aa  235  2e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  37.05 
 
 
465 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.0295e-06  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.44 
 
 
506 aa  233  4e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  32.74 
 
 
462 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  4.03403e-07  unclonable  1.36332e-10 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  32.82 
 
 
450 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.22 
 
 
534 aa  233  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.6 
 
 
489 aa  233  7e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  35.77 
 
 
524 aa  233  7e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 
509 aa  231  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.988303  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.81 
 
 
516 aa  231  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  3.522e-07  unclonable  7.22922e-12 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  32.29 
 
 
479 aa  231  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  30.86 
 
 
478 aa  230  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 
467 aa  230  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  5.58594e-06  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  31.1 
 
 
492 aa  230  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 
467 aa  230  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  32.29 
 
 
462 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.81438e-07  unclonable  1.18337e-08 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 
467 aa  230  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.26813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  32.4 
 
 
467 aa  230  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 
467 aa  230  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.01887e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 
467 aa  230  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.02031e-05  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.4 
 
 
467 aa  230  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.36922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.73 
 
 
528 aa  229  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 
467 aa  229  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.02 
 
 
527 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 
467 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  6.6194e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 
490 aa  228  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  35.51 
 
 
436 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  31.79 
 
 
445 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.8 
 
 
469 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.2 
 
 
587 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0001  chromosomal replication initiation protein  31.61 
 
 
516 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  34.19 
 
 
460 aa  228  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.79736e-07  unclonable  3.13535e-11 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  34.19 
 
 
460 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81375e-07  unclonable  6.00935e-11 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  33.66 
 
 
478 aa  228  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 
451 aa  228  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.64 
 
 
453 aa  228  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  32.18 
 
 
465 aa  228  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 
451 aa  228  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  1.23931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  34.19 
 
 
460 aa  227  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 
462 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.62887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.03 
 
 
721 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  4.23182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 
462 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 
462 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 
462 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.57358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 
461 aa  227  5e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.1e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.46 
 
 
591 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0001  chromosomal replication initiation protein  36.86 
 
 
500 aa  226  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.94 
 
 
450 aa  226  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  31.1 
 
 
490 aa  226  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  30.26 
 
 
441 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  32.74 
 
 
460 aa  226  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.24276e-06  unclonable  1.76e-05 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  34.22 
 
 
470 aa  226  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  33.95 
 
 
511 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  32.76 
 
 
466 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.32 
 
 
462 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  30.12 
 
 
480 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  6.50471e-10 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>