More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00010 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 501 aa  1040    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000175242  decreased coverage  0.000074483 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  51 
 
 		 520 aa  514  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000222997  hitchhiker  0.00000014852 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.47 
 
 		 506 aa  492  9.999999999999999e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.993036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  34.21 
 
 		 460 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  33 
 
 		 457 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  32.59 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  32.77 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  34.2 
 
 		 458 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  32.34 
 
 		 500 aa  250  4e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.25 
 
 		 480 aa  247  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  31.14 
 
 		 446 aa  247  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  31.14 
 
 		 446 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  30.94 
 
 		 446 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  30.94 
 
 		 446 aa  246  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  30.94 
 
 		 446 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  30.94 
 
 		 446 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  30.94 
 
 		 446 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  31.45 
 
 		 440 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  31.14 
 
 		 446 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  32.38 
 
 		 472 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  32.19 
 
 		 489 aa  243  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  35.22 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  30.94 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  31.95 
 
 		 492 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.45 
 
 		 453 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  30.74 
 
 		 446 aa  239  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  30.46 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  30.26 
 
 		 450 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.91 
 
 		 509 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.19 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  31.64 
 
 		 443 aa  237  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0045  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.21 
 
 		 539 aa  237  4e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 446 aa  237  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 452 aa  237  4e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.57 
 
 		 458 aa  236  8e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  31.01 
 
 		 494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  31.54 
 
 		 491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.49 
 
 		 454 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  31.84 
 
 		 495 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  31.38 
 
 		 481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  31.84 
 
 		 495 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  32.12 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  30.36 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  33.47 
 
 		 448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  31.84 
 
 		 495 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  37.05 
 
 		 465 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000010295  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.44 
 
 		 506 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  32.74 
 
 		 462 aa  233  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  32.82 
 
 		 450 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.22 
 
 		 534 aa  233  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.6 
 
 		 489 aa  233  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  35.77 
 
 		 524 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.988303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.81 
 
 		 516 aa  231  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000003522  unclonable  0.00000000000722922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  32.29 
 
 		 479 aa  231  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  30.86 
 
 		 478 aa  230  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  31.1 
 
 		 492 aa  230  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 		 467 aa  230  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 		 467 aa  230  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.4 
 
 		 467 aa  230  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 		 467 aa  230  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  32.29 
 
 		 462 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  32.4 
 
 		 467 aa  230  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 		 467 aa  230  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 		 467 aa  230  6e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.73 
 
 		 528 aa  229  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 		 467 aa  229  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.02 
 
 		 527 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  31.79 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.2 
 
 		 587 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.8 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  32.4 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0001  chromosomal replication initiation protein  31.61 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  35.51 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  32.18 
 
 		 465 aa  228  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  33.66 
 
 		 478 aa  228  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  34.19 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.64 
 
 		 453 aa  228  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 451 aa  228  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 451 aa  228  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  34.19 
 
 		 460 aa  228  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  34.19 
 
 		 460 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.03 
 
 		 721 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 		 462 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 		 462 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 		 462 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 		 462 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  32.96 
 
 		 461 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.46 
 
 		 591 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0001  chromosomal replication initiation protein  36.86 
 
 		 500 aa  226  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.94 
 
 		 450 aa  226  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  31.1 
 
 		 490 aa  226  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  32.74 
 
 		 460 aa  226  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  30.26 
 
 		 441 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  34.22 
 
 		 470 aa  226  9e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.88 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  30.12 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  32.76 
 
 		 466 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  33.95 
 
 		 511 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>