299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_R0030 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0048  tRNA-Gly  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0048  tRNA-Gly  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0106217  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0005  tRNA-Gly  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0008  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.142347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0054  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0271354  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0037  tRNA-Gly  92.54 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0019  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00502278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0048  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105769  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0051  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0500664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0052  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt08  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.711822  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt09  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.745225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0060  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0060  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.766632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0045  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.471231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0061  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.638683  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0959  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0058  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0055  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  91.04 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0028  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0030  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000189578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0007  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0002  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.367155  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0839  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.343418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0005  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0004  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.679327 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4576  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0002  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00924229  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.611211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0042  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443767  normal  0.830121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0029  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0022  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t34  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.417453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  88.31 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0024  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1013  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0909  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0037  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.133837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0055  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000930206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA4  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489059 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0028  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000319369  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt13  tRNA-Gly  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0015  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0016  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    88.16 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0043  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000132411  normal  0.194852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0001  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0015  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000158444  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0055  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.835398  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0028  tRNA-Gly  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000469989  normal  0.0212427 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0050  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00165947  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07190  tRNA-Gly  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.886703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0026  tRNA-Gly  88.06 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390133  normal  0.0221224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0041  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0025  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly02  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0038  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148988  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0050  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0006  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14070  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0010  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.695097  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0031  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.495434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0011  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.770603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>