More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4085 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
746 aa  1520    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.94 
 
 
758 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.87 
 
 
696 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  34.85 
 
 
794 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.9 
 
 
754 aa  360  6e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  33.62 
 
 
744 aa  359  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.98 
 
 
658 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  33.43 
 
 
734 aa  350  8e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  31.71 
 
 
741 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  31.36 
 
 
738 aa  326  1e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.1 
 
 
672 aa  324  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.67 
 
 
656 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  30.49 
 
 
701 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  30.91 
 
 
758 aa  316  8e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  30.82 
 
 
758 aa  316  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.89 
 
 
758 aa  315  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.55 
 
 
737 aa  311  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  35.21 
 
 
670 aa  300  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  30.62 
 
 
752 aa  294  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  32.42 
 
 
614 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  34.97 
 
 
665 aa  279  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  30.91 
 
 
696 aa  276  8e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  29.12 
 
 
721 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  35.68 
 
 
936 aa  267  5.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.87 
 
 
694 aa  265  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.54 
 
 
753 aa  265  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  29.54 
 
 
729 aa  265  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  32.54 
 
 
729 aa  262  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.72 
 
 
764 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  30.52 
 
 
756 aa  259  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  33.03 
 
 
717 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  30.82 
 
 
725 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  28.75 
 
 
638 aa  254  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  29.84 
 
 
760 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  30.5 
 
 
759 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.3 
 
 
723 aa  251  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 
641 aa  249  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.65 
 
 
611 aa  246  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.49 
 
 
723 aa  243  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.17 
 
 
761 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.73 
 
 
656 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  41.78 
 
 
860 aa  234  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  41.49 
 
 
861 aa  231  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.52 
 
 
657 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  40.33 
 
 
903 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  39.07 
 
 
864 aa  221  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
645 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.27 
 
 
703 aa  217  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  29.89 
 
 
667 aa  217  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  38.98 
 
 
859 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  29.25 
 
 
607 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  38.99 
 
 
702 aa  213  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.8 
 
 
701 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  38.85 
 
 
701 aa  208  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  38.49 
 
 
701 aa  207  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 
731 aa  207  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  36.36 
 
 
650 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  37.97 
 
 
858 aa  196  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  37.54 
 
 
911 aa  196  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  30.67 
 
 
735 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  36.91 
 
 
593 aa  193  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 
744 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  39.08 
 
 
713 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.14 
 
 
597 aa  187  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.58 
 
 
652 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  47.14 
 
 
284 aa  182  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  37.4 
 
 
797 aa  181  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  34.36 
 
 
632 aa  179  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  29.02 
 
 
712 aa  179  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  33.71 
 
 
582 aa  178  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  34.11 
 
 
724 aa  177  8e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.33 
 
 
643 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.81 
 
 
757 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.85 
 
 
678 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  41.9 
 
 
1119 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  40.95 
 
 
431 aa  173  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  40.52 
 
 
441 aa  171  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  41.33 
 
 
1207 aa  171  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  27.08 
 
 
632 aa  170  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  32.76 
 
 
641 aa  169  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  31.29 
 
 
726 aa  169  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  33.99 
 
 
740 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  25.07 
 
 
753 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  34.77 
 
 
364 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  24.2 
 
 
643 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  31.97 
 
 
636 aa  163  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  41.67 
 
 
528 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  40.49 
 
 
518 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.15 
 
 
622 aa  160  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.86 
 
 
650 aa  159  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  35.47 
 
 
483 aa  158  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  35.47 
 
 
483 aa  158  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  40.6 
 
 
515 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 
1805 aa  157  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.84 
 
 
585 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 
479 aa  154  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  33.45 
 
 
675 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  36.6 
 
 
482 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  38.18 
 
 
523 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.9 
 
 
825 aa  152  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>