150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4030 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_4030  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
173 aa  360  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.65 
 
 
173 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  32.39 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  28.97 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  23.29 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  29.25 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  23.65 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.65 
 
 
155 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0350  cyclic nucleotide-binding protein  31.34 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  27.14 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  28.1 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.95 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  27.34 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  27.73 
 
 
149 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.34 
 
 
151 aa  57.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  28.89 
 
 
194 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  28.89 
 
 
149 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.93 
 
 
239 aa  57.4  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.95 
 
 
226 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  25.38 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  27.42 
 
 
454 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  28.89 
 
 
149 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  28.33 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.6 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  28.33 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  27.94 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.01 
 
 
224 aa  55.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  27.41 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.82 
 
 
228 aa  54.7  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.73 
 
 
232 aa  54.7  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.37 
 
 
226 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  26.81 
 
 
225 aa  54.3  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  24.09 
 
 
563 aa  54.3  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  30.51 
 
 
412 aa  54.3  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0093  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.45 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.132878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
413 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  25 
 
 
419 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
238 aa  52  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  34.78 
 
 
225 aa  52  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  25.83 
 
 
152 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
225 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.64 
 
 
225 aa  51.2  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.47 
 
 
225 aa  51.2  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.13 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0086  cyclic nucleotide-binding protein  25.69 
 
 
160 aa  51.2  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.929528  normal  0.0740226 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.41 
 
 
228 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  29.06 
 
 
286 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
242 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0441  cyclic nucleotide-binding  26.92 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  26.43 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0230  cyclic nucleotide-binding protein  29.13 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253117  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  25.42 
 
 
407 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  23.23 
 
 
308 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.87 
 
 
238 aa  48.9  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
218 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  27.97 
 
 
224 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.24 
 
 
228 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.97 
 
 
224 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  25.9 
 
 
239 aa  48.5  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
224 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2556  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.49 
 
 
198 aa  47.8  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  26.67 
 
 
161 aa  47.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  26.15 
 
 
454 aa  47.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  24.29 
 
 
868 aa  47.4  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4229  hypothetical protein  28.35 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000114025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.24 
 
 
227 aa  47.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.8 
 
 
224 aa  47.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  24.22 
 
 
322 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
231 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0380  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.15 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  27.97 
 
 
636 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
224 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
224 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
224 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
227 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.42 
 
 
224 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1135  cyclic nucleotide-binding protein  28.89 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.37 
 
 
236 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.27 
 
 
224 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  27.2 
 
 
214 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.48 
 
 
228 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  31.93 
 
 
225 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.49 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  25.34 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
225 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.53 
 
 
227 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.26 
 
 
224 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.66 
 
 
228 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  24.81 
 
 
923 aa  45.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.06 
 
 
224 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 
582 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
229 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3549  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 
582 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.864417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 
419 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.81 
 
 
1056 aa  45.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>