32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4020 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  669    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  29.8 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  29.8 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  33.55 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  25.07 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  26.29 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  27.13 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  28.62 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  29.15 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  27.76 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  32.48 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  26.83 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  26.76 
 
 		 218 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  24.5 
 
 		 218 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  24.78 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  24.15 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2511  MJ0042 family finger-like protein  27.05 
 
 		 442 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  26.51 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  30.67 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  32.06 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  29.41 
 
 		 452 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1763  integral membrane protein  27.63 
 
 		 200 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00234926  normal  0.0438415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1712  MJ0042 family finger-like protein  31.58 
 
 		 446 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  31.06 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1349  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  29.79 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2090  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  47  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2662  hypothetical protein  27.04 
 
 		 490 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0661  hypothetical protein  27.08 
 
 		 282 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  37.5 
 
 		 241 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13380  predicted integral membrane protein  27.27 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271933  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1249  hypothetical protein  30.43 
 
 		 195 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000710568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>