More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3983 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
949 aa  1958  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  28.67 
 
 
1009 aa  352  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.47 
 
 
809 aa  277  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
1060 aa  248  5e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  27.72 
 
 
828 aa  237  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.26 
 
 
957 aa  234  8e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 
454 aa  211  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.52 
 
 
1186 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 
991 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  40.13 
 
 
825 aa  208  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  31.92 
 
 
2145 aa  204  7e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  33.75 
 
 
1550 aa  203  1e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  40.31 
 
 
751 aa  197  8e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  37.74 
 
 
1039 aa  194  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.47 
 
 
1424 aa  188  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  37.95 
 
 
924 aa  186  2e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  35.97 
 
 
1040 aa  186  2e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  33.69 
 
 
1328 aa  184  9e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
1215 aa  182  3e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.79 
 
 
568 aa  181  6e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 
568 aa  181  6e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.71 
 
 
787 aa  179  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 
1105 aa  176  2e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.82587e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.9 
 
 
767 aa  176  2e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
444 aa  174  6e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.48 
 
 
885 aa  167  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  33.91 
 
 
919 aa  166  2e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  35.89 
 
 
1228 aa  165  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 
284 aa  165  4e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.53 
 
 
771 aa  164  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 
1288 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.47 
 
 
991 aa  161  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  32.01 
 
 
843 aa  160  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  37.87 
 
 
493 aa  160  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  31.33 
 
 
950 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  36.32 
 
 
311 aa  159  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  31.59 
 
 
950 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  32.73 
 
 
1212 aa  157  8e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  33.54 
 
 
732 aa  155  3e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 
911 aa  155  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  35.5 
 
 
814 aa  154  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  30.97 
 
 
1507 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  28.33 
 
 
1404 aa  149  2e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  27.36 
 
 
740 aa  149  2e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  33.77 
 
 
1106 aa  149  2e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  29.58 
 
 
822 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  31.02 
 
 
919 aa  148  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  35.49 
 
 
447 aa  148  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 
905 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 
905 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
966 aa  146  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 
854 aa  145  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.82 
 
 
854 aa  145  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 
857 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  29.89 
 
 
891 aa  143  1e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.45 
 
 
3298 aa  143  1e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.23 
 
 
3419 aa  142  2e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  29.77 
 
 
1262 aa  142  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.23 
 
 
3535 aa  142  4e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 
883 aa  142  4e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  28.29 
 
 
782 aa  142  4e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  31.43 
 
 
963 aa  141  5e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  31.62 
 
 
672 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 
1290 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  31.17 
 
 
1131 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
885 aa  139  3e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  29.02 
 
 
828 aa  139  3e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.29 
 
 
1162 aa  139  3e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.38 
 
 
1650 aa  139  3e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 
1162 aa  139  3e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.68 
 
 
1772 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 
2741 aa  138  6e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  29.15 
 
 
1050 aa  137  7e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
796 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.58 
 
 
2741 aa  136  1e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  30.29 
 
 
1056 aa  136  2e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  31.94 
 
 
686 aa  136  2e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 
953 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
1028 aa  134  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
868 aa  133  1e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  2.28127e-06  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.69 
 
 
694 aa  133  2e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.54 
 
 
725 aa  133  2e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  28.62 
 
 
362 aa  132  2e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.57 
 
 
3537 aa  133  2e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
1313 aa  132  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  27.91 
 
 
853 aa  131  5e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  30 
 
 
836 aa  131  5e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
1088 aa  131  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
851 aa  130  1e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 
481 aa  130  2e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 
1101 aa  129  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  32.39 
 
 
680 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.64 
 
 
3299 aa  128  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  31.48 
 
 
799 aa  128  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  28.44 
 
 
1488 aa  127  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  32.38 
 
 
702 aa  124  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  30.67 
 
 
801 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 
1279 aa  124  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  29.71 
 
 
1044 aa  123  1e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
443 aa  121  5e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>