186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3972 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3972  hypothetical protein  100 
 
 
544 aa  1112    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.220987  normal  0.634668 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2188  protein of unknown function DUF885  25.79 
 
 
542 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2501  putative lipoprotein  26.23 
 
 
540 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.137553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1391  protein of unknown function DUF885  25.17 
 
 
583 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1990  hypothetical protein  24.57 
 
 
590 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2053  hypothetical protein  24.57 
 
 
590 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.807252  hitchhiker  0.000853258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2005  hypothetical protein  24.39 
 
 
590 aa  98.2  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0461311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2949  hypothetical protein  22.59 
 
 
635 aa  98.2  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2334  protein of unknown function DUF885  24.2 
 
 
590 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000423863  normal  0.0462508 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1237  protein of unknown function DUF885  24.2 
 
 
602 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157803  normal  0.118959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1907  hypothetical protein  23 
 
 
609 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000056708  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1935  hypothetical protein  23.46 
 
 
592 aa  95.9  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00034791  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5177  protein of unknown function DUF885  29.68 
 
 
543 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5817  hypothetical protein  24.95 
 
 
536 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  28.86 
 
 
599 aa  88.2  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  31.08 
 
 
621 aa  88.2  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  31.53 
 
 
635 aa  87.8  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4171  hypothetical protein  26.24 
 
 
496 aa  87.8  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0258196  normal  0.693173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  31.53 
 
 
635 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  31.53 
 
 
635 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  30.2 
 
 
602 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  28.86 
 
 
591 aa  84  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2317  hypothetical protein  24.51 
 
 
592 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000037575  hitchhiker  0.00132048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2570  putative lipoprotein  23.71 
 
 
592 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  29.47 
 
 
601 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  29.47 
 
 
601 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  28.65 
 
 
618 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  29.09 
 
 
607 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  29.47 
 
 
601 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  29.09 
 
 
607 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2237  hypothetical protein  23.99 
 
 
590 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000589696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  25.83 
 
 
617 aa  81.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  29.09 
 
 
607 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2375  putative lipoprotein  23.93 
 
 
596 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0787288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  28.16 
 
 
601 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  27.95 
 
 
619 aa  81.3  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  25.68 
 
 
603 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  27.9 
 
 
603 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  31.49 
 
 
551 aa  80.9  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2167  hypothetical protein  22.87 
 
 
596 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.363343  normal  0.850087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  27.9 
 
 
603 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  27.9 
 
 
603 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  27.9 
 
 
603 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2293  hypothetical protein  23.22 
 
 
591 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000993307  normal  0.679763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2244  hypothetical protein  22.87 
 
 
596 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81668  normal  0.576675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  27.75 
 
 
599 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  28.48 
 
 
227 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  28.66 
 
 
614 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1770  hypothetical protein  23.32 
 
 
590 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.989562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  25.86 
 
 
608 aa  79  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  27.88 
 
 
611 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  28.48 
 
 
614 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  28.66 
 
 
614 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  29.7 
 
 
587 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  25.48 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  25.48 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  25.1 
 
 
609 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  25.48 
 
 
611 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  28.66 
 
 
614 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0408  protein of unknown function DUF885  32.12 
 
 
610 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  28.02 
 
 
599 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  28.05 
 
 
617 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  27.02 
 
 
594 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  31.95 
 
 
590 aa  77  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  25.27 
 
 
628 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1976  protein of unknown function DUF885  25.36 
 
 
628 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0897671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1717  putative lipoprotein  22.09 
 
 
595 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.271095  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  28.49 
 
 
595 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1385  hypothetical protein  24.39 
 
 
575 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  28.43 
 
 
619 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  25.19 
 
 
611 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  25 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  27.73 
 
 
628 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  26.4 
 
 
605 aa  74.7  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  23.25 
 
 
609 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  29.94 
 
 
583 aa  74.7  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  25.51 
 
 
621 aa  74.7  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2151  hypothetical protein  23.22 
 
 
599 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0849922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  23.25 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  23.25 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  25.41 
 
 
609 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  25.39 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  28.24 
 
 
586 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  24.59 
 
 
607 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  26.44 
 
 
622 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  28.32 
 
 
624 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  30.9 
 
 
610 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  26.37 
 
 
629 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  29.24 
 
 
625 aa  72.4  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  24.48 
 
 
616 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  28.92 
 
 
566 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  27.94 
 
 
629 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  25.95 
 
 
592 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  28.92 
 
 
593 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0683  hypothetical protein  25.44 
 
 
502 aa  71.6  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3852  hypothetical protein  31.55 
 
 
586 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  26.76 
 
 
1283 aa  71.6  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  23.66 
 
 
616 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  28.14 
 
 
589 aa  70.1  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  25.75 
 
 
602 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>