136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3847 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  34.4 
 
 
1440 aa  663    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  34.87 
 
 
1339 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  100 
 
 
1441 aa  2944    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  35.03 
 
 
1365 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  34.87 
 
 
1339 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  59.88 
 
 
846 aa  989    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  49.46 
 
 
1452 aa  1326    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  49.39 
 
 
1461 aa  1350    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  35.43 
 
 
1346 aa  693    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  35.12 
 
 
1363 aa  701    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  45 
 
 
1409 aa  1084    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  35.63 
 
 
1347 aa  693    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  33.45 
 
 
1366 aa  630  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  31.94 
 
 
1347 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  32.95 
 
 
1321 aa  599  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  32.59 
 
 
1342 aa  586  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  32.53 
 
 
1353 aa  506  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  29.34 
 
 
1290 aa  347  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  32.25 
 
 
1243 aa  342  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  27.82 
 
 
1282 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0416  hypothetical protein  31.87 
 
 
536 aa  253  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2201  hypothetical protein  30.39 
 
 
512 aa  217  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00286901  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  29.53 
 
 
1581 aa  182  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  31.19 
 
 
1432 aa  176  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  27.41 
 
 
1375 aa  154  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  30.03 
 
 
1343 aa  145  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  30.21 
 
 
1022 aa  145  7e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  31.59 
 
 
1422 aa  144  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  29.74 
 
 
1319 aa  141  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  25.65 
 
 
1612 aa  141  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  31.94 
 
 
1338 aa  138  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  27.59 
 
 
1712 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  31.26 
 
 
1709 aa  135  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3686  hypothetical protein  25.85 
 
 
918 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.619967  normal 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  26.44 
 
 
1278 aa  131  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  24.35 
 
 
1277 aa  130  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4987  hypothetical protein  24.96 
 
 
1154 aa  129  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0015789  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  27.43 
 
 
1572 aa  129  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  30 
 
 
1358 aa  127  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4156  hypothetical protein  26.67 
 
 
1151 aa  125  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  30.17 
 
 
1098 aa  125  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  28.72 
 
 
1306 aa  124  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.78 
 
 
1331 aa  123  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2985  hypothetical protein  24.19 
 
 
1173 aa  122  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0952598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  39.77 
 
 
1338 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  29.48 
 
 
1336 aa  120  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  28.86 
 
 
1355 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7058  hypothetical protein  25.25 
 
 
1188 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.48722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  38.38 
 
 
1339 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4327  hypothetical protein  24.75 
 
 
1170 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  29.61 
 
 
1318 aa  113  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  35.91 
 
 
1426 aa  114  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  25 
 
 
1557 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  41.18 
 
 
1322 aa  113  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  27.7 
 
 
1321 aa  111  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  36.13 
 
 
1354 aa  111  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  27.98 
 
 
1459 aa  110  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  22.96 
 
 
978 aa  109  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  36.61 
 
 
1373 aa  110  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  25.27 
 
 
1644 aa  110  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2740  hypothetical protein  26.64 
 
 
1018 aa  107  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1460  Type II restriction enzyme methylase subunits-like  24.57 
 
 
1186 aa  107  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.811371  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  24.89 
 
 
1751 aa  104  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  37.65 
 
 
1219 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  32.77 
 
 
1333 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1365  hypothetical protein  26.82 
 
 
925 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3225  hypothetical protein  23.75 
 
 
869 aa  102  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  32.09 
 
 
1332 aa  100  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  27.57 
 
 
1349 aa  100  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  30.59 
 
 
1575 aa  99.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  29.15 
 
 
1442 aa  95.5  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3238  hypothetical protein  23.6 
 
 
1184 aa  94  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0308131  normal  0.512831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  33.91 
 
 
1055 aa  93.6  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.29 
 
 
1573 aa  92.8  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  28.25 
 
 
1322 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  34.1 
 
 
1579 aa  87.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  31.55 
 
 
1640 aa  87  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  31.55 
 
 
1642 aa  86.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  22.09 
 
 
1257 aa  85.9  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.25 
 
 
1640 aa  85.5  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  22.84 
 
 
1252 aa  84.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3857  hypothetical protein  26.42 
 
 
973 aa  85.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.663936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  25 
 
 
1184 aa  84.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  21.68 
 
 
1250 aa  80.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  21.97 
 
 
1250 aa  80.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  31.02 
 
 
1581 aa  80.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  30.11 
 
 
1546 aa  80.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  21.53 
 
 
1244 aa  79.7  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  22.66 
 
 
1256 aa  79.7  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  34.04 
 
 
974 aa  79  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0261  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.75 
 
 
909 aa  76.3  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.504808  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  26.76 
 
 
1088 aa  74.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  27.01 
 
 
1186 aa  73.2  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  24.51 
 
 
1159 aa  72.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  22.57 
 
 
1089 aa  72.4  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  30.54 
 
 
926 aa  71.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.37 
 
 
1194 aa  70.5  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  25.38 
 
 
882 aa  69.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1426  RNA-binding region RNP-1  24.79 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  24.44 
 
 
838 aa  68.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>