More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3790 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0907  Zn-finger, CHC2 type  75.95 
 
 		 1098 aa  1724    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1921  DNA primase-like  99 
 
 		 1103 aa  2270    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3790  DNA primase catalytic core  100 
 
 		 1103 aa  2288    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0772  DNA primase catalytic core domain protein  39.35 
 
 		 1026 aa  171  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0630  DNA primase catalytic core domain protein  38.99 
 
 		 1026 aa  170  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  26.85 
 
 		 599 aa  94.7  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  24.34 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  24.59 
 
 		 605 aa  81.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  25.14 
 
 		 546 aa  80.9  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  24.32 
 
 		 605 aa  79.7  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  25.07 
 
 		 535 aa  80.1  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  25.61 
 
 		 600 aa  77  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 604 aa  76.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  29.64 
 
 		 638 aa  77  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  26.03 
 
 		 601 aa  76.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  25.75 
 
 		 598 aa  76.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  27.84 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  23.72 
 
 		 572 aa  75.5  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  25.95 
 
 		 593 aa  75.5  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  27.3 
 
 		 583 aa  75.5  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  25.47 
 
 		 571 aa  75.1  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  25.47 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  25.47 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  26.32 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  25.47 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  25.47 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  25.47 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  25.2 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  25.47 
 
 		 598 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  25.2 
 
 		 598 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  28 
 
 		 679 aa  73.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  27.18 
 
 		 660 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  27.44 
 
 		 660 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  27.41 
 
 		 565 aa  72  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  27.18 
 
 		 660 aa  72  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  27.97 
 
 		 651 aa  71.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  25.54 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  23.98 
 
 		 595 aa  70.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  26.49 
 
 		 652 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  25.54 
 
 		 572 aa  71.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  26.42 
 
 		 663 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  27.16 
 
 		 652 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  24.69 
 
 		 655 aa  70.1  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  26.19 
 
 		 587 aa  70.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  23.14 
 
 		 595 aa  70.5  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  26.42 
 
 		 664 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  28.45 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  26.92 
 
 		 660 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  27.3 
 
 		 577 aa  68.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  22.62 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  24.93 
 
 		 578 aa  68.2  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  25.83 
 
 		 583 aa  68.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3449  DNA primase  25.14 
 
 		 646 aa  68.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  25.83 
 
 		 583 aa  68.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  24.13 
 
 		 675 aa  67.4  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  28.86 
 
 		 565 aa  67.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  25.81 
 
 		 576 aa  67.4  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  24.75 
 
 		 666 aa  67  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  24.02 
 
 		 544 aa  66.6  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  25.66 
 
 		 631 aa  67  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2607  DNA primase  28.06 
 
 		 613 aa  66.6  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.496345  normal  0.674189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  25.45 
 
 		 575 aa  66.6  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  25.29 
 
 		 596 aa  67  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  25.6 
 
 		 651 aa  66.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1610  DNA primase  23.5 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  23.51 
 
 		 550 aa  66.6  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2050  DNA primase  27.59 
 
 		 643 aa  66.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.279269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  28.38 
 
 		 623 aa  66.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  25 
 
 		 601 aa  65.9  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  26.25 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  25.62 
 
 		 627 aa  65.5  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  24.41 
 
 		 602 aa  65.5  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  24.42 
 
 		 577 aa  65.1  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0397  DNA primase  27.3 
 
 		 643 aa  65.1  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  26.64 
 
 		 684 aa  65.1  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  25.93 
 
 		 573 aa  64.7  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  26.91 
 
 		 686 aa  64.7  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  25.77 
 
 		 630 aa  64.7  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  24.56 
 
 		 632 aa  63.9  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  26.53 
 
 		 641 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  27.1 
 
 		 604 aa  64.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  23.92 
 
 		 595 aa  64.3  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  25.71 
 
 		 624 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  25.66 
 
 		 585 aa  63.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  27.2 
 
 		 655 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  25.66 
 
 		 677 aa  63.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  23.81 
 
 		 604 aa  63.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  24.46 
 
 		 634 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  24.45 
 
 		 573 aa  63.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  25.33 
 
 		 677 aa  63.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  23.59 
 
 		 578 aa  62.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  24.03 
 
 		 574 aa  63.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  27 
 
 		 682 aa  62.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  27.47 
 
 		 677 aa  63.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0761  DNA primase  24.01 
 
 		 588 aa  63.2  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.573465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  21.34 
 
 		 617 aa  63.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  28.25 
 
 		 632 aa  63.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  25.53 
 
 		 574 aa  63.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  25.53 
 
 		 574 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  23.66 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>