209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3767 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  40.09 
 
 
276 aa  176  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  38.16 
 
 
274 aa  174  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  41.81 
 
 
274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 
283 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  34.35 
 
 
288 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.62 
 
 
374 aa  142  6e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.18 
 
 
379 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.18 
 
 
383 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  36.84 
 
 
505 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.18 
 
 
383 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  35.81 
 
 
288 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.18 
 
 
383 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.76 
 
 
383 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.63 
 
 
379 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.63 
 
 
379 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.54 
 
 
383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.63 
 
 
379 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  29.02 
 
 
443 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  29.02 
 
 
439 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.63 
 
 
379 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.1 
 
 
384 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  29.02 
 
 
443 aa  128  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 
379 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 
439 aa  126  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.74 
 
 
384 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.36 
 
 
379 aa  125  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  29.22 
 
 
447 aa  125  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.8 
 
 
379 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  28.03 
 
 
437 aa  122  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.62 
 
 
372 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.45 
 
 
384 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.05 
 
 
373 aa  121  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.05 
 
 
373 aa  121  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.05 
 
 
373 aa  121  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.19 
 
 
384 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.62 
 
 
373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  31.06 
 
 
279 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.89 
 
 
375 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.62 
 
 
373 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.9 
 
 
373 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.46 
 
 
375 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.9 
 
 
373 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.9 
 
 
373 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  32.76 
 
 
373 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.76 
 
 
373 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  32.76 
 
 
373 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.63 
 
 
373 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.9 
 
 
373 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.19 
 
 
373 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.76 
 
 
373 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.62 
 
 
373 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.76 
 
 
373 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.76 
 
 
373 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.76 
 
 
373 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  32.76 
 
 
373 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  37.74 
 
 
706 aa  115  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 
373 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.48 
 
 
375 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 
373 aa  115  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.26 
 
 
375 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  29.82 
 
 
375 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.44 
 
 
377 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.6 
 
 
381 aa  108  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  29.11 
 
 
374 aa  99.4  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  32.46 
 
 
373 aa  98.6  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  31.94 
 
 
373 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  32.62 
 
 
375 aa  95.9  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  25.71 
 
 
371 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  27.63 
 
 
294 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  28.49 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  31.69 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  27.57 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  25.73 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  25.15 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  28.02 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  26.64 
 
 
266 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  27.04 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  29.26 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  30.32 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  22.75 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  25.35 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  25.35 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  30.61 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  30.61 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.87 
 
 
307 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  26.17 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  25.97 
 
 
288 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.86 
 
 
311 aa  62  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  23.16 
 
 
292 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  29.79 
 
 
339 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  24.77 
 
 
375 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  27.81 
 
 
289 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  28.34 
 
 
308 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  27.81 
 
 
329 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  27.81 
 
 
329 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  27.81 
 
 
308 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  27.96 
 
 
295 aa  59.3  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.37 
 
 
308 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>