More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3712 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3712  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
385 aa  775    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.040259  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1118  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.15 
 
 
384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.721957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2662  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.4 
 
 
385 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0683  aminotransferase, class I and II  41.67 
 
 
424 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422989  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1008  aminotransferase class I and II  43.86 
 
 
446 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.899799 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0113  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.6 
 
 
394 aa  243  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2838  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.87 
 
 
389 aa  234  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.19 
 
 
395 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.92 
 
 
395 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2457  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.86 
 
 
399 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.39 
 
 
394 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.3 
 
 
395 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.56 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0027  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.76 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.87483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.03 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.3 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.3 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.3 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2429  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.58 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.99 
 
 
396 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.75 
 
 
390 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2189  8-amino-7-oxononanoate synthase  36 
 
 
388 aa  219  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0079  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.13 
 
 
394 aa  218  1e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.76 
 
 
395 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.84 
 
 
391 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.52 
 
 
396 aa  216  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.47 
 
 
396 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0859  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.93 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2069  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.81 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.27 
 
 
390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  33.51 
 
 
395 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2963  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.36 
 
 
385 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  37 
 
 
392 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_002950  PG1195  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.41 
 
 
382 aa  207  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.760383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.36 
 
 
396 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.6 
 
 
397 aa  206  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.47 
 
 
390 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.68 
 
 
391 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1326  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.04 
 
 
384 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  34.9 
 
 
428 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.91 
 
 
391 aa  203  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.88 
 
 
388 aa  202  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3456  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.52 
 
 
403 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0094566  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.01 
 
 
390 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0680  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.19 
 
 
385 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2538  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.04 
 
 
384 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00272507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1662  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.08 
 
 
391 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1506  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.36 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00648154  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0613  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.07 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2856  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.7 
 
 
390 aa  199  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.36 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2344  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.6 
 
 
403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  34.45 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.58 
 
 
395 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.62 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00743  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.94 
 
 
384 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0830  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.94 
 
 
384 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2867  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.94 
 
 
384 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00148387  normal  0.0589709 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00760  hypothetical protein  34.94 
 
 
384 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00012618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2866  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.94 
 
 
384 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000062905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.19 
 
 
391 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0839  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.94 
 
 
384 aa  195  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000113881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0924  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.94 
 
 
384 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00304993  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  35.13 
 
 
396 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.21 
 
 
393 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2775  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.43 
 
 
396 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00358245  normal  0.0206135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2576  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.66 
 
 
384 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828217  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2441  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.34 
 
 
382 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0031  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.13 
 
 
395 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3561  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.89 
 
 
397 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.63 
 
 
386 aa  193  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0799  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.14 
 
 
384 aa  192  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000322202  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.84 
 
 
391 aa  192  9e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  31.54 
 
 
395 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.64 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.96 
 
 
384 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  30.83 
 
 
391 aa  188  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0389  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.01 
 
 
390 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.598299 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003870  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.42 
 
 
383 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.697906  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  31.65 
 
 
393 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3900  serine palmitoyltransferase  34.11 
 
 
400 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673344  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  31.28 
 
 
395 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3534  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.17 
 
 
398 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  33.52 
 
 
401 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1996  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.59 
 
 
396 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  30.5 
 
 
393 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.59 
 
 
396 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.81 
 
 
389 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.96 
 
 
501 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.31 
 
 
404 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0419  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.47 
 
 
389 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0243  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.47 
 
 
389 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.53 
 
 
390 aa  186  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1393  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.06 
 
 
387 aa  186  8e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2755  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.3 
 
 
394 aa  186  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2897  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.11 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786658  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3111  serine palmitoyltransferase  32.07 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2068  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.01 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.02 
 
 
381 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01808  8-amino-7-oxononanoate synthase  31.91 
 
 
383 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>