158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3701 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  100 
 
 
279 aa  573  1e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  49.81 
 
 
270 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  46.47 
 
 
269 aa  254  1e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  36.3 
 
 
268 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  35.46 
 
 
275 aa  139  4e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  35.04 
 
 
273 aa  139  5e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 
352 aa  137  3e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  32.88 
 
 
302 aa  135  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  1.51267e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  31.32 
 
 
270 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  29.59 
 
 
275 aa  129  8e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  27.92 
 
 
279 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  32.99 
 
 
283 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  29.66 
 
 
264 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  28.37 
 
 
283 aa  117  2e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  29.6 
 
 
274 aa  115  1e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  33.57 
 
 
279 aa  112  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.92 
 
 
291 aa  111  1e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  29.37 
 
 
283 aa  111  1e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  28.03 
 
 
286 aa  110  2e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  28.72 
 
 
286 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  30.77 
 
 
263 aa  109  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
293 aa  108  8e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  29.56 
 
 
280 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  4.70965e-06  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
287 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  31.25 
 
 
302 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  31.62 
 
 
291 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.34 
 
 
278 aa  99.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  32.07 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.64 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  32.06 
 
 
276 aa  95.5  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  33.18 
 
 
254 aa  94  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  31.41 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  29.43 
 
 
278 aa  92.8  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  4.79797e-05 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  30.92 
 
 
273 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  30.92 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  29.48 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  25.34 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  30.3 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  26.81 
 
 
280 aa  84.7  1e-15  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  23.57 
 
 
291 aa  84  2e-15  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  27.83 
 
 
277 aa  82.4  7e-15  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  28.32 
 
 
292 aa  82  9e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  27.62 
 
 
276 aa  79.7  5e-14  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  27.16 
 
 
323 aa  79.3  6e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  30.7 
 
 
277 aa  76.6  4e-13  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  5.29075e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  29.8 
 
 
191 aa  76.3  6e-13  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  29 
 
 
298 aa  75.5  1e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  30.54 
 
 
274 aa  75.1  1e-12  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  27.27 
 
 
279 aa  73.9  2e-12  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  21.9 
 
 
268 aa  73.2  5e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 
293 aa  72.4  8e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  27.05 
 
 
299 aa  72  9e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  29.5 
 
 
319 aa  71.6  1e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  27.64 
 
 
286 aa  71.2  2e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.5 
 
 
275 aa  68.2  1e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  28.37 
 
 
291 aa  68.6  1e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  25.44 
 
 
295 aa  68.6  1e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  25.49 
 
 
289 aa  66.2  5e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  32.87 
 
 
284 aa  63.5  4e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  22.39 
 
 
268 aa  60.5  3e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  28.26 
 
 
279 aa  60.5  3e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  30 
 
 
232 aa  60.1  4e-08  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  23.66 
 
 
270 aa  58.5  1e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  32.14 
 
 
256 aa  54.3  2e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
288 aa  54.7  2e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
267 aa  54.3  2e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  26.06 
 
 
253 aa  53.9  3e-06  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  28.17 
 
 
284 aa  53.1  5e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
250 aa  52.8  6e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 
259 aa  52.4  8e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  23.59 
 
 
287 aa  52.4  8e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  27.41 
 
 
237 aa  52  1e-05  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
256 aa  51.6  1e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  5.01952e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8959  hypothetical protein  37.37 
 
 
261 aa  51.2  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  22.32 
 
 
239 aa  50.8  2e-05  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 
257 aa  50.8  2e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
250 aa  50.8  3e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.96 
 
 
250 aa  50.4  3e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
250 aa  50.1  4e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
250 aa  50.1  4e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
280 aa  50.1  4e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2351  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
263 aa  50.1  4e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0117235  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
259 aa  50.1  4e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
250 aa  50.1  4e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  31.96 
 
 
250 aa  50.1  4e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  25.19 
 
 
239 aa  49.3  7e-05  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  47.06 
 
 
210 aa  48.9  8e-05  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
219 aa  48.9  9e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  24.71 
 
 
263 aa  48.9  9e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
218 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.08 
 
 
209 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.15 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.46 
 
 
254 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>