More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3689 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  28.78 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  27.22 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  25.67 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2408  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  26.46 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  25.95 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  25.13 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 198 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
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NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  22.07 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.86 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
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NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
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