83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3656 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  100 
 
 
346 aa  696    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  45.11 
 
 
383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  45.17 
 
 
363 aa  282  5.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  49.31 
 
 
364 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  43.72 
 
 
388 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  46.43 
 
 
384 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0081  PilT protein domain protein  49.15 
 
 
364 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0085  PilT protein domain protein  47.96 
 
 
364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0127482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0186  PilT domain-containing protein  43.06 
 
 
380 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0260  PilT protein domain protein  48.3 
 
 
383 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000167901  normal  0.0149964 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5221  hypothetical protein  43.42 
 
 
367 aa  262  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102382  unclonable  1.43587e-25 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0174  PilT protein domain protein  45.59 
 
 
367 aa  261  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0084  hypothetical protein  43.06 
 
 
369 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0084  hypothetical protein  43.06 
 
 
369 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0083  hypothetical protein  43.06 
 
 
369 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0081  hypothetical protein  43.06 
 
 
369 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0080  hypothetical protein  43.06 
 
 
369 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0165  PilT protein domain protein  52.63 
 
 
366 aa  259  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  43.06 
 
 
370 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0105  hypothetical protein  43.06 
 
 
369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0079  PilT domain-containing protein  43.3 
 
 
367 aa  258  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0185  PilT domain-containing protein  48.12 
 
 
371 aa  251  9.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000117639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2427  PIN/TRAM domain-containing protein  46.43 
 
 
368 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2740  PIN/TRAM domain-containing protein  60.51 
 
 
368 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  41.41 
 
 
359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0115  PilT protein domain protein  51 
 
 
257 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.673954  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0400  PilT protein domain protein  49.83 
 
 
369 aa  242  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0838  PilT domain-containing protein  45.92 
 
 
367 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000323541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1561  PilT protein domain protein  43.75 
 
 
357 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3506  PilT protein domain protein  45.85 
 
 
360 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  0.104798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2600  PilT protein domain protein  45.85 
 
 
360 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4268  PilT protein domain-containing protein  42.36 
 
 
358 aa  237  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040207  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0302  PilT domain-containing protein  42.27 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  42.41 
 
 
359 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2222  PilT protein-like  45 
 
 
358 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4460  PilT protein domain protein  40 
 
 
360 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1002  PilT protein domain protein  43.23 
 
 
377 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000369877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  55.84 
 
 
269 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  56.84 
 
 
366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  45.58 
 
 
383 aa  222  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1515  PilT protein domain protein  47.27 
 
 
331 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0341  PilT protein domain protein  44.77 
 
 
346 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1733  PilT domain-containing protein  39.79 
 
 
361 aa  205  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.147599 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  40.54 
 
 
361 aa  202  5e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2116  PilT domain-containing protein  34.2 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2018  PilT domain-containing protein  47.14 
 
 
364 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  39.44 
 
 
358 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0095  PilT protein domain protein  58.02 
 
 
168 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33572e-62 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0185  PilT domain-containing protein  37.91 
 
 
385 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000320699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  38.35 
 
 
357 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  38.35 
 
 
357 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3254  PilT protein domain protein  33.9 
 
 
366 aa  189  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1298  PilT protein domain protein  37.69 
 
 
346 aa  188  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  38.95 
 
 
385 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2177  PilT protein domain protein  47.5 
 
 
344 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1657  PilT domain-containing protein  48.02 
 
 
355 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145178  normal  0.591632 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  44.56 
 
 
371 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  36.57 
 
 
369 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  36.57 
 
 
369 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0878  PIN domain superfamily protein  37.21 
 
 
369 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412243  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17331  integral membrane protein  37.21 
 
 
369 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.07903  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  34.28 
 
 
385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  37.05 
 
 
369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20011  integral membrane protein  41.58 
 
 
389 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192672 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  41.79 
 
 
388 aa  159  8e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14731  integral membrane protein  35.85 
 
 
369 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.961128  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  45.41 
 
 
361 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  28.89 
 
 
631 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  31.82 
 
 
642 aa  53.9  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  31.62 
 
 
602 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  29.37 
 
 
655 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  29.37 
 
 
658 aa  50.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0130  Nucleotide binding protein PINc  47.83 
 
 
161 aa  47  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.285361  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  24.67 
 
 
671 aa  46.6  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  30.66 
 
 
633 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  30.61 
 
 
618 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  30.37 
 
 
633 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  28.89 
 
 
629 aa  43.5  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  33.6 
 
 
634 aa  43.5  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1882  Nucleotide binding protein PINc  27.07 
 
 
815 aa  43.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000064311  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  30.77 
 
 
625 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  28.57 
 
 
605 aa  42.7  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  30 
 
 
631 aa  42.7  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>